Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RILPQ96NA2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RILPQ96NA2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RILPQ96NA2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RILPQ96NA2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RILPQ96NA2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RILPQ96NA2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RILPQ96NA2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RILPQ96NA2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RILPQ96NA2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RILPQ96NA2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RILPQ96NA2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RILPQ96NA2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RILPQ96NA2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RILPQ96NA2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RILPQ96NA2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RILPQ96NA2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RILPQ96NA2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RILPQ96NA2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RILPQ96NA2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RILPQ96NA2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RILPQ96NA2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RILPQ96NA2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RILPQ96NA2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RILPQ96NA2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RILPQ96NA2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RILPQ96NA2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RILPQ96NA2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RILPQ96NA2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RILPQ96NA2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RILPQ96NA2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RILPQ96NA2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RILPQ96NA2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RILPQ96NA2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RILPQ96NA2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RILPQ96NA2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RILPQ96NA2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RILPQ96NA2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RILPQ96NA2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RILPQ96NA2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RILPQ96NA2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RILPQ96NA2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RILPQ96NA2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RILPQ96NA2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RILPQ96NA2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RILPQ96NA2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RILPQ96NA2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RILPQ96NA2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RILPQ96NA2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RILPQ96NA2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RILPQ96NA2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RILPQ96NA2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RILPQ96NA2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RILPQ96NA2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RILPQ96NA2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RILPQ96NA2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RILPQ96NA2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RILPQ96NA2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RILPQ96NA2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RILPQ96NA2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RILPQ96NA2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RILPQ96NA2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RILPQ96NA2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RILPQ96NA2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RILPQ96NA2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RILPQ96NA2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RILPQ96NA2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RILPQ96NA2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RILPQ96NA2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RILPQ96NA2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RILPQ96NA2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RILPQ96NA2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RILPQ96NA2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RILPQ96NA2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RILPQ96NA2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RILPQ96NA2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RILPQ96NA2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RILPQ96NA2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RILPQ96NA2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RILPQ96NA2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RILPQ96NA2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RILPQ96NA2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RILPQ96NA2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RILPQ96NA2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RILPQ96NA2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RILPQ96NA2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RILPQ96NA2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RILPQ96NA2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RILPQ96NA2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RILPQ96NA2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RILPQ96NA2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RILPQ96NA2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RILPQ96NA2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RILPQ96NA2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RILPQ96NA2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RILPQ96NA2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RILPQ96NA2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RILPQ96NA2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RILPQ96NA2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RILPQ96NA2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms