Protein–RNA interactions for Protein: Q96MV1

TMEM56, Transmembrane protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM56Q96MV1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM56Q96MV1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM56Q96MV1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM56Q96MV1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM56Q96MV1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM56Q96MV1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM56Q96MV1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM56Q96MV1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM56Q96MV1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM56Q96MV1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM56Q96MV1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM56Q96MV1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM56Q96MV1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM56Q96MV1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM56Q96MV1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM56Q96MV1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM56Q96MV1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM56Q96MV1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM56Q96MV1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM56Q96MV1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM56Q96MV1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM56Q96MV1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM56Q96MV1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM56Q96MV1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM56Q96MV1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM56Q96MV1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM56Q96MV1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM56Q96MV1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM56Q96MV1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM56Q96MV1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM56Q96MV1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM56Q96MV1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM56Q96MV1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM56Q96MV1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM56Q96MV1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM56Q96MV1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM56Q96MV1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM56Q96MV1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM56Q96MV1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM56Q96MV1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM56Q96MV1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM56Q96MV1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM56Q96MV1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM56Q96MV1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM56Q96MV1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM56Q96MV1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM56Q96MV1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM56Q96MV1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM56Q96MV1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM56Q96MV1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM56Q96MV1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM56Q96MV1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM56Q96MV1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM56Q96MV1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM56Q96MV1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM56Q96MV1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM56Q96MV1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM56Q96MV1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM56Q96MV1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM56Q96MV1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM56Q96MV1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM56Q96MV1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM56Q96MV1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM56Q96MV1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM56Q96MV1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM56Q96MV1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM56Q96MV1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM56Q96MV1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM56Q96MV1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM56Q96MV1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM56Q96MV1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM56Q96MV1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM56Q96MV1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM56Q96MV1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM56Q96MV1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM56Q96MV1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM56Q96MV1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM56Q96MV1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM56Q96MV1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM56Q96MV1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM56Q96MV1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM56Q96MV1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM56Q96MV1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM56Q96MV1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM56Q96MV1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM56Q96MV1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM56Q96MV1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM56Q96MV1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM56Q96MV1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM56Q96MV1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM56Q96MV1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM56Q96MV1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM56Q96MV1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM56Q96MV1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM56Q96MV1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM56Q96MV1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM56Q96MV1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM56Q96MV1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM56Q96MV1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM56Q96MV1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms