Protein–RNA interactions for Protein: Q96MI6

PPM1M, Protein phosphatase 1M, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1MQ96MI6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPM1MQ96MI6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PPM1MQ96MI6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPM1MQ96MI6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPM1MQ96MI6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPM1MQ96MI6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPM1MQ96MI6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPM1MQ96MI6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPM1MQ96MI6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPM1MQ96MI6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPM1MQ96MI6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPM1MQ96MI6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPM1MQ96MI6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPM1MQ96MI6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPM1MQ96MI6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPM1MQ96MI6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPM1MQ96MI6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPM1MQ96MI6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPM1MQ96MI6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPM1MQ96MI6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPM1MQ96MI6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPM1MQ96MI6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPM1MQ96MI6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPM1MQ96MI6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPM1MQ96MI6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPM1MQ96MI6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPM1MQ96MI6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPM1MQ96MI6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPM1MQ96MI6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPM1MQ96MI6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPM1MQ96MI6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPM1MQ96MI6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPM1MQ96MI6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPM1MQ96MI6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPM1MQ96MI6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPM1MQ96MI6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPM1MQ96MI6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPM1MQ96MI6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPM1MQ96MI6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPM1MQ96MI6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPM1MQ96MI6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPM1MQ96MI6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPM1MQ96MI6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPM1MQ96MI6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPM1MQ96MI6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPM1MQ96MI6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PPM1MQ96MI6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPM1MQ96MI6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPM1MQ96MI6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPM1MQ96MI6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPM1MQ96MI6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPM1MQ96MI6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPM1MQ96MI6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PPM1MQ96MI6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPM1MQ96MI6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPM1MQ96MI6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPM1MQ96MI6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPM1MQ96MI6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPM1MQ96MI6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPM1MQ96MI6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPM1MQ96MI6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPM1MQ96MI6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPM1MQ96MI6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPM1MQ96MI6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPM1MQ96MI6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPM1MQ96MI6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PPM1MQ96MI6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPM1MQ96MI6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPM1MQ96MI6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPM1MQ96MI6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPM1MQ96MI6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPM1MQ96MI6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPM1MQ96MI6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPM1MQ96MI6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PPM1MQ96MI6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPM1MQ96MI6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPM1MQ96MI6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPM1MQ96MI6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPM1MQ96MI6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPM1MQ96MI6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPM1MQ96MI6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPM1MQ96MI6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPM1MQ96MI6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPM1MQ96MI6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPM1MQ96MI6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPM1MQ96MI6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPM1MQ96MI6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPM1MQ96MI6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPM1MQ96MI6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPM1MQ96MI6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPM1MQ96MI6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPM1MQ96MI6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPM1MQ96MI6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPM1MQ96MI6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPM1MQ96MI6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPM1MQ96MI6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPM1MQ96MI6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PPM1MQ96MI6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPM1MQ96MI6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPM1MQ96MI6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms