Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC138Q96M89 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC138Q96M89 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC138Q96M89 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC138Q96M89 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC138Q96M89 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC138Q96M89 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC138Q96M89 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC138Q96M89 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC138Q96M89 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC138Q96M89 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC138Q96M89 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC138Q96M89 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC138Q96M89 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC138Q96M89 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC138Q96M89 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC138Q96M89 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC138Q96M89 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC138Q96M89 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC138Q96M89 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC138Q96M89 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC138Q96M89 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC138Q96M89 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC138Q96M89 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC138Q96M89 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC138Q96M89 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC138Q96M89 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC138Q96M89 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC138Q96M89 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC138Q96M89 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC138Q96M89 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC138Q96M89 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC138Q96M89 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC138Q96M89 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC138Q96M89 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC138Q96M89 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC138Q96M89 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC138Q96M89 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC138Q96M89 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC138Q96M89 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC138Q96M89 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC138Q96M89 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC138Q96M89 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC138Q96M89 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC138Q96M89 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC138Q96M89 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC138Q96M89 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC138Q96M89 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC138Q96M89 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC138Q96M89 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC138Q96M89 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC138Q96M89 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC138Q96M89 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC138Q96M89 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC138Q96M89 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC138Q96M89 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC138Q96M89 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC138Q96M89 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC138Q96M89 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC138Q96M89 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC138Q96M89 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC138Q96M89 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC138Q96M89 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC138Q96M89 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC138Q96M89 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC138Q96M89 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC138Q96M89 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC138Q96M89 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC138Q96M89 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC138Q96M89 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC138Q96M89 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC138Q96M89 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC138Q96M89 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC138Q96M89 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC138Q96M89 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC138Q96M89 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC138Q96M89 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC138Q96M89 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC138Q96M89 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC138Q96M89 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC138Q96M89 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC138Q96M89 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC138Q96M89 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC138Q96M89 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC138Q96M89 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC138Q96M89 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC138Q96M89 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC138Q96M89 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC138Q96M89 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC138Q96M89 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC138Q96M89 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC138Q96M89 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC138Q96M89 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC138Q96M89 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC138Q96M89 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC138Q96M89 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC138Q96M89 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC138Q96M89 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC138Q96M89 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC138Q96M89 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms