Protein–RNA interactions for Protein: Q96M42

LINC00479, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00479, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00479Q96M42 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00479Q96M42 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00479Q96M42 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00479Q96M42 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00479Q96M42 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00479Q96M42 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00479Q96M42 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00479Q96M42 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00479Q96M42 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00479Q96M42 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00479Q96M42 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00479Q96M42 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00479Q96M42 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00479Q96M42 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00479Q96M42 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00479Q96M42 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00479Q96M42 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00479Q96M42 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00479Q96M42 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00479Q96M42 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00479Q96M42 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00479Q96M42 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00479Q96M42 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00479Q96M42 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00479Q96M42 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00479Q96M42 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00479Q96M42 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00479Q96M42 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00479Q96M42 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00479Q96M42 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00479Q96M42 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00479Q96M42 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00479Q96M42 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00479Q96M42 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00479Q96M42 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00479Q96M42 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00479Q96M42 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00479Q96M42 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00479Q96M42 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00479Q96M42 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00479Q96M42 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00479Q96M42 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00479Q96M42 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00479Q96M42 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00479Q96M42 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00479Q96M42 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00479Q96M42 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00479Q96M42 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LINC00479Q96M42 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LINC00479Q96M42 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00479Q96M42 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00479Q96M42 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00479Q96M42 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00479Q96M42 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00479Q96M42 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00479Q96M42 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00479Q96M42 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC00479Q96M42 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC00479Q96M42 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC00479Q96M42 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC00479Q96M42 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00479Q96M42 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00479Q96M42 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00479Q96M42 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00479Q96M42 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00479Q96M42 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00479Q96M42 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00479Q96M42 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC00479Q96M42 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC00479Q96M42 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC00479Q96M42 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC00479Q96M42 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC00479Q96M42 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC00479Q96M42 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC00479Q96M42 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC00479Q96M42 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LINC00479Q96M42 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LINC00479Q96M42 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LINC00479Q96M42 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LINC00479Q96M42 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LINC00479Q96M42 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC00479Q96M42 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC00479Q96M42 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC00479Q96M42 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC00479Q96M42 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC00479Q96M42 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC00479Q96M42 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC00479Q96M42 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC00479Q96M42 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC00479Q96M42 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LINC00479Q96M42 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC00479Q96M42 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC00479Q96M42 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00479Q96M42 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00479Q96M42 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00479Q96M42 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00479Q96M42 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00479Q96M42 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00479Q96M42 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00479Q96M42 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms