Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SERAC1Q96JX3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SERAC1Q96JX3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SERAC1Q96JX3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SERAC1Q96JX3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SERAC1Q96JX3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SERAC1Q96JX3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SERAC1Q96JX3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SERAC1Q96JX3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SERAC1Q96JX3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SERAC1Q96JX3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SERAC1Q96JX3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SERAC1Q96JX3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SERAC1Q96JX3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SERAC1Q96JX3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SERAC1Q96JX3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SERAC1Q96JX3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SERAC1Q96JX3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SERAC1Q96JX3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SERAC1Q96JX3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SERAC1Q96JX3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SERAC1Q96JX3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SERAC1Q96JX3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SERAC1Q96JX3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SERAC1Q96JX3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SERAC1Q96JX3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SERAC1Q96JX3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SERAC1Q96JX3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SERAC1Q96JX3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SERAC1Q96JX3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SERAC1Q96JX3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SERAC1Q96JX3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SERAC1Q96JX3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SERAC1Q96JX3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SERAC1Q96JX3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SERAC1Q96JX3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SERAC1Q96JX3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SERAC1Q96JX3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SERAC1Q96JX3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SERAC1Q96JX3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SERAC1Q96JX3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SERAC1Q96JX3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SERAC1Q96JX3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SERAC1Q96JX3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SERAC1Q96JX3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SERAC1Q96JX3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SERAC1Q96JX3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SERAC1Q96JX3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SERAC1Q96JX3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SERAC1Q96JX3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SERAC1Q96JX3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SERAC1Q96JX3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SERAC1Q96JX3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SERAC1Q96JX3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SERAC1Q96JX3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SERAC1Q96JX3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SERAC1Q96JX3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SERAC1Q96JX3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SERAC1Q96JX3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SERAC1Q96JX3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SERAC1Q96JX3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SERAC1Q96JX3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SERAC1Q96JX3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SERAC1Q96JX3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SERAC1Q96JX3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SERAC1Q96JX3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SERAC1Q96JX3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SERAC1Q96JX3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SERAC1Q96JX3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SERAC1Q96JX3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SERAC1Q96JX3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SERAC1Q96JX3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SERAC1Q96JX3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SERAC1Q96JX3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SERAC1Q96JX3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SERAC1Q96JX3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SERAC1Q96JX3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SERAC1Q96JX3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SERAC1Q96JX3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SERAC1Q96JX3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SERAC1Q96JX3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SERAC1Q96JX3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SERAC1Q96JX3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SERAC1Q96JX3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SERAC1Q96JX3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SERAC1Q96JX3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SERAC1Q96JX3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SERAC1Q96JX3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SERAC1Q96JX3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SERAC1Q96JX3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SERAC1Q96JX3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SERAC1Q96JX3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SERAC1Q96JX3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SERAC1Q96JX3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SERAC1Q96JX3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SERAC1Q96JX3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SERAC1Q96JX3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SERAC1Q96JX3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SERAC1Q96JX3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SERAC1Q96JX3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 839.2 ms