Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ABCC12Q96J65 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ABCC12Q96J65 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ABCC12Q96J65 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
ABCC12Q96J65 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ABCC12Q96J65 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ABCC12Q96J65 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ABCC12Q96J65 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ABCC12Q96J65 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ABCC12Q96J65 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ABCC12Q96J65 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC12Q96J65 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC12Q96J65 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC12Q96J65 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC12Q96J65 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC12Q96J65 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC12Q96J65 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC12Q96J65 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC12Q96J65 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC12Q96J65 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.2■■■□□ 2.9
ABCC12Q96J65 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
ABCC12Q96J65 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ABCC12Q96J65 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ABCC12Q96J65 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ABCC12Q96J65 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ABCC12Q96J65 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ABCC12Q96J65 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ABCC12Q96J65 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ABCC12Q96J65 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ABCC12Q96J65 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ABCC12Q96J65 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ABCC12Q96J65 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ABCC12Q96J65 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ABCC12Q96J65 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCC12Q96J65 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCC12Q96J65 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCC12Q96J65 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCC12Q96J65 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCC12Q96J65 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCC12Q96J65 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCC12Q96J65 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCC12Q96J65 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCC12Q96J65 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCC12Q96J65 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ABCC12Q96J65 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ABCC12Q96J65 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ABCC12Q96J65 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ABCC12Q96J65 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ABCC12Q96J65 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
ABCC12Q96J65 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ABCC12Q96J65 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ABCC12Q96J65 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
ABCC12Q96J65 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ABCC12Q96J65 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ABCC12Q96J65 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ABCC12Q96J65 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ABCC12Q96J65 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ABCC12Q96J65 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
ABCC12Q96J65 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ABCC12Q96J65 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
ABCC12Q96J65 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
ABCC12Q96J65 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
ABCC12Q96J65 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
ABCC12Q96J65 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ABCC12Q96J65 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
ABCC12Q96J65 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
ABCC12Q96J65 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
ABCC12Q96J65 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ABCC12Q96J65 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ABCC12Q96J65 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ABCC12Q96J65 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ABCC12Q96J65 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ABCC12Q96J65 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ABCC12Q96J65 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ABCC12Q96J65 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ABCC12Q96J65 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ABCC12Q96J65 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ABCC12Q96J65 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ABCC12Q96J65 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ABCC12Q96J65 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ABCC12Q96J65 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ABCC12Q96J65 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ABCC12Q96J65 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ABCC12Q96J65 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ABCC12Q96J65 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ABCC12Q96J65 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ABCC12Q96J65 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ABCC12Q96J65 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ABCC12Q96J65 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ABCC12Q96J65 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ABCC12Q96J65 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ABCC12Q96J65 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ABCC12Q96J65 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ABCC12Q96J65 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ABCC12Q96J65 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ABCC12Q96J65 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ABCC12Q96J65 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ABCC12Q96J65 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ABCC12Q96J65 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
ABCC12Q96J65 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms