Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC22AQ96IW7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC22AQ96IW7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC22AQ96IW7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC22AQ96IW7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC22AQ96IW7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC22AQ96IW7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC22AQ96IW7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SEC22AQ96IW7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC22AQ96IW7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC22AQ96IW7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC22AQ96IW7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC22AQ96IW7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC22AQ96IW7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC22AQ96IW7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC22AQ96IW7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC22AQ96IW7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC22AQ96IW7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC22AQ96IW7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC22AQ96IW7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC22AQ96IW7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC22AQ96IW7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC22AQ96IW7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC22AQ96IW7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC22AQ96IW7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEC22AQ96IW7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC22AQ96IW7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC22AQ96IW7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEC22AQ96IW7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEC22AQ96IW7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEC22AQ96IW7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEC22AQ96IW7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC22AQ96IW7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC22AQ96IW7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC22AQ96IW7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC22AQ96IW7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC22AQ96IW7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC22AQ96IW7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC22AQ96IW7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC22AQ96IW7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC22AQ96IW7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC22AQ96IW7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC22AQ96IW7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC22AQ96IW7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC22AQ96IW7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC22AQ96IW7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC22AQ96IW7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC22AQ96IW7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC22AQ96IW7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC22AQ96IW7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC22AQ96IW7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC22AQ96IW7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC22AQ96IW7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SEC22AQ96IW7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC22AQ96IW7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC22AQ96IW7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC22AQ96IW7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC22AQ96IW7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC22AQ96IW7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC22AQ96IW7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEC22AQ96IW7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC22AQ96IW7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC22AQ96IW7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEC22AQ96IW7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC22AQ96IW7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEC22AQ96IW7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC22AQ96IW7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC22AQ96IW7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEC22AQ96IW7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC22AQ96IW7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC22AQ96IW7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC22AQ96IW7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC22AQ96IW7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC22AQ96IW7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC22AQ96IW7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEC22AQ96IW7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC22AQ96IW7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC22AQ96IW7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC22AQ96IW7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC22AQ96IW7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC22AQ96IW7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEC22AQ96IW7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC22AQ96IW7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC22AQ96IW7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC22AQ96IW7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEC22AQ96IW7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC22AQ96IW7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC22AQ96IW7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC22AQ96IW7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC22AQ96IW7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC22AQ96IW7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC22AQ96IW7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC22AQ96IW7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC22AQ96IW7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC22AQ96IW7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC22AQ96IW7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC22AQ96IW7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC22AQ96IW7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC22AQ96IW7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC22AQ96IW7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms