Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE4

CCDC126, Coiled-coil domain-containing protein 126, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC126Q96EE4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC126Q96EE4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC126Q96EE4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC126Q96EE4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC126Q96EE4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC126Q96EE4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC126Q96EE4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC126Q96EE4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC126Q96EE4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC126Q96EE4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC126Q96EE4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC126Q96EE4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC126Q96EE4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC126Q96EE4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC126Q96EE4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC126Q96EE4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC126Q96EE4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC126Q96EE4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC126Q96EE4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC126Q96EE4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC126Q96EE4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC126Q96EE4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC126Q96EE4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC126Q96EE4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC126Q96EE4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC126Q96EE4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC126Q96EE4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC126Q96EE4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC126Q96EE4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC126Q96EE4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC126Q96EE4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC126Q96EE4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC126Q96EE4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC126Q96EE4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC126Q96EE4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC126Q96EE4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC126Q96EE4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC126Q96EE4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC126Q96EE4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC126Q96EE4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC126Q96EE4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC126Q96EE4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC126Q96EE4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC126Q96EE4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC126Q96EE4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC126Q96EE4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC126Q96EE4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC126Q96EE4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC126Q96EE4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC126Q96EE4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC126Q96EE4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC126Q96EE4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC126Q96EE4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC126Q96EE4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC126Q96EE4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC126Q96EE4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC126Q96EE4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC126Q96EE4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC126Q96EE4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC126Q96EE4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC126Q96EE4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC126Q96EE4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC126Q96EE4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC126Q96EE4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC126Q96EE4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC126Q96EE4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC126Q96EE4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC126Q96EE4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC126Q96EE4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC126Q96EE4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC126Q96EE4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC126Q96EE4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC126Q96EE4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC126Q96EE4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC126Q96EE4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC126Q96EE4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC126Q96EE4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC126Q96EE4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC126Q96EE4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC126Q96EE4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC126Q96EE4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC126Q96EE4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC126Q96EE4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC126Q96EE4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC126Q96EE4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC126Q96EE4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC126Q96EE4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC126Q96EE4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC126Q96EE4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC126Q96EE4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC126Q96EE4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC126Q96EE4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC126Q96EE4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC126Q96EE4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC126Q96EE4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC126Q96EE4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC126Q96EE4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC126Q96EE4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC126Q96EE4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC126Q96EE4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms