Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SHISA4Q96DD7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SHISA4Q96DD7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SHISA4Q96DD7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SHISA4Q96DD7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SHISA4Q96DD7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SHISA4Q96DD7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SHISA4Q96DD7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SHISA4Q96DD7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SHISA4Q96DD7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SHISA4Q96DD7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SHISA4Q96DD7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SHISA4Q96DD7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SHISA4Q96DD7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SHISA4Q96DD7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SHISA4Q96DD7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SHISA4Q96DD7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SHISA4Q96DD7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SHISA4Q96DD7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SHISA4Q96DD7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SHISA4Q96DD7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SHISA4Q96DD7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SHISA4Q96DD7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SHISA4Q96DD7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SHISA4Q96DD7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SHISA4Q96DD7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SHISA4Q96DD7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SHISA4Q96DD7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
SHISA4Q96DD7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SHISA4Q96DD7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SHISA4Q96DD7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SHISA4Q96DD7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
SHISA4Q96DD7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SHISA4Q96DD7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SHISA4Q96DD7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SHISA4Q96DD7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SHISA4Q96DD7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SHISA4Q96DD7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SHISA4Q96DD7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SHISA4Q96DD7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SHISA4Q96DD7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SHISA4Q96DD7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SHISA4Q96DD7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SHISA4Q96DD7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SHISA4Q96DD7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SHISA4Q96DD7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SHISA4Q96DD7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
SHISA4Q96DD7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SHISA4Q96DD7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SHISA4Q96DD7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SHISA4Q96DD7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SHISA4Q96DD7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SHISA4Q96DD7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SHISA4Q96DD7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SHISA4Q96DD7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SHISA4Q96DD7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SHISA4Q96DD7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SHISA4Q96DD7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
SHISA4Q96DD7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
SHISA4Q96DD7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
SHISA4Q96DD7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SHISA4Q96DD7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SHISA4Q96DD7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SHISA4Q96DD7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SHISA4Q96DD7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SHISA4Q96DD7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SHISA4Q96DD7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SHISA4Q96DD7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SHISA4Q96DD7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SHISA4Q96DD7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SHISA4Q96DD7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SHISA4Q96DD7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SHISA4Q96DD7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SHISA4Q96DD7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
SHISA4Q96DD7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SHISA4Q96DD7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SHISA4Q96DD7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SHISA4Q96DD7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SHISA4Q96DD7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SHISA4Q96DD7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SHISA4Q96DD7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SHISA4Q96DD7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SHISA4Q96DD7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SHISA4Q96DD7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SHISA4Q96DD7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SHISA4Q96DD7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
SHISA4Q96DD7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SHISA4Q96DD7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SHISA4Q96DD7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SHISA4Q96DD7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SHISA4Q96DD7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SHISA4Q96DD7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SHISA4Q96DD7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SHISA4Q96DD7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SHISA4Q96DD7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
SHISA4Q96DD7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
SHISA4Q96DD7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SHISA4Q96DD7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SHISA4Q96DD7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SHISA4Q96DD7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms