Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC7

TMCO6, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO6Q96DC7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMCO6Q96DC7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMCO6Q96DC7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMCO6Q96DC7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMCO6Q96DC7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMCO6Q96DC7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMCO6Q96DC7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TMCO6Q96DC7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMCO6Q96DC7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMCO6Q96DC7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMCO6Q96DC7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMCO6Q96DC7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TMCO6Q96DC7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMCO6Q96DC7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMCO6Q96DC7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMCO6Q96DC7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMCO6Q96DC7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMCO6Q96DC7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMCO6Q96DC7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMCO6Q96DC7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMCO6Q96DC7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMCO6Q96DC7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMCO6Q96DC7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMCO6Q96DC7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMCO6Q96DC7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMCO6Q96DC7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMCO6Q96DC7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMCO6Q96DC7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMCO6Q96DC7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO6Q96DC7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO6Q96DC7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO6Q96DC7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO6Q96DC7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO6Q96DC7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO6Q96DC7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO6Q96DC7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO6Q96DC7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO6Q96DC7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO6Q96DC7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO6Q96DC7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO6Q96DC7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO6Q96DC7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO6Q96DC7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO6Q96DC7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO6Q96DC7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO6Q96DC7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO6Q96DC7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO6Q96DC7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO6Q96DC7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO6Q96DC7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO6Q96DC7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO6Q96DC7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO6Q96DC7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO6Q96DC7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO6Q96DC7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO6Q96DC7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO6Q96DC7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO6Q96DC7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO6Q96DC7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO6Q96DC7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO6Q96DC7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO6Q96DC7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO6Q96DC7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO6Q96DC7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO6Q96DC7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCO6Q96DC7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMCO6Q96DC7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCO6Q96DC7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCO6Q96DC7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCO6Q96DC7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCO6Q96DC7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO6Q96DC7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO6Q96DC7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO6Q96DC7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO6Q96DC7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO6Q96DC7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO6Q96DC7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO6Q96DC7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO6Q96DC7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO6Q96DC7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO6Q96DC7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO6Q96DC7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMCO6Q96DC7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMCO6Q96DC7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO6Q96DC7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO6Q96DC7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO6Q96DC7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO6Q96DC7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO6Q96DC7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO6Q96DC7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO6Q96DC7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO6Q96DC7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO6Q96DC7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO6Q96DC7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO6Q96DC7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO6Q96DC7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO6Q96DC7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO6Q96DC7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO6Q96DC7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO6Q96DC7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms