Protein–RNA interactions for Protein: Q96CU9

FOXRED1, FAD-dependent oxidoreductase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXRED1Q96CU9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXRED1Q96CU9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXRED1Q96CU9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXRED1Q96CU9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXRED1Q96CU9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXRED1Q96CU9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXRED1Q96CU9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXRED1Q96CU9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXRED1Q96CU9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXRED1Q96CU9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXRED1Q96CU9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXRED1Q96CU9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXRED1Q96CU9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXRED1Q96CU9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXRED1Q96CU9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXRED1Q96CU9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXRED1Q96CU9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXRED1Q96CU9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXRED1Q96CU9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXRED1Q96CU9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXRED1Q96CU9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXRED1Q96CU9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXRED1Q96CU9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXRED1Q96CU9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXRED1Q96CU9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXRED1Q96CU9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXRED1Q96CU9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXRED1Q96CU9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXRED1Q96CU9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXRED1Q96CU9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXRED1Q96CU9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXRED1Q96CU9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXRED1Q96CU9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXRED1Q96CU9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXRED1Q96CU9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXRED1Q96CU9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXRED1Q96CU9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXRED1Q96CU9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXRED1Q96CU9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXRED1Q96CU9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXRED1Q96CU9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXRED1Q96CU9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXRED1Q96CU9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXRED1Q96CU9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXRED1Q96CU9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXRED1Q96CU9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXRED1Q96CU9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXRED1Q96CU9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXRED1Q96CU9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXRED1Q96CU9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXRED1Q96CU9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXRED1Q96CU9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXRED1Q96CU9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXRED1Q96CU9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXRED1Q96CU9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXRED1Q96CU9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FOXRED1Q96CU9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXRED1Q96CU9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXRED1Q96CU9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXRED1Q96CU9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXRED1Q96CU9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXRED1Q96CU9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXRED1Q96CU9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXRED1Q96CU9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXRED1Q96CU9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXRED1Q96CU9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXRED1Q96CU9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXRED1Q96CU9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXRED1Q96CU9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXRED1Q96CU9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXRED1Q96CU9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXRED1Q96CU9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXRED1Q96CU9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXRED1Q96CU9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXRED1Q96CU9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXRED1Q96CU9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXRED1Q96CU9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXRED1Q96CU9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXRED1Q96CU9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXRED1Q96CU9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXRED1Q96CU9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXRED1Q96CU9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXRED1Q96CU9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXRED1Q96CU9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXRED1Q96CU9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXRED1Q96CU9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXRED1Q96CU9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXRED1Q96CU9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXRED1Q96CU9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXRED1Q96CU9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXRED1Q96CU9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXRED1Q96CU9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXRED1Q96CU9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXRED1Q96CU9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXRED1Q96CU9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXRED1Q96CU9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXRED1Q96CU9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXRED1Q96CU9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXRED1Q96CU9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXRED1Q96CU9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms