Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
GCC1Q96CN9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
GCC1Q96CN9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
GCC1Q96CN9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GCC1Q96CN9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
GCC1Q96CN9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GCC1Q96CN9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
GCC1Q96CN9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
GCC1Q96CN9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
GCC1Q96CN9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
GCC1Q96CN9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
GCC1Q96CN9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
GCC1Q96CN9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
GCC1Q96CN9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
GCC1Q96CN9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
GCC1Q96CN9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
GCC1Q96CN9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
GCC1Q96CN9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
GCC1Q96CN9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
GCC1Q96CN9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
GCC1Q96CN9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
GCC1Q96CN9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
GCC1Q96CN9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
GCC1Q96CN9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
GCC1Q96CN9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GCC1Q96CN9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GCC1Q96CN9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GCC1Q96CN9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GCC1Q96CN9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
GCC1Q96CN9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
GCC1Q96CN9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
GCC1Q96CN9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GCC1Q96CN9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
GCC1Q96CN9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GCC1Q96CN9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
GCC1Q96CN9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GCC1Q96CN9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
GCC1Q96CN9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GCC1Q96CN9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
GCC1Q96CN9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GCC1Q96CN9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
GCC1Q96CN9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GCC1Q96CN9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GCC1Q96CN9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GCC1Q96CN9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
GCC1Q96CN9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GCC1Q96CN9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
GCC1Q96CN9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
GCC1Q96CN9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GCC1Q96CN9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GCC1Q96CN9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
GCC1Q96CN9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GCC1Q96CN9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GCC1Q96CN9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GCC1Q96CN9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GCC1Q96CN9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
GCC1Q96CN9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GCC1Q96CN9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GCC1Q96CN9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
GCC1Q96CN9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
GCC1Q96CN9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
GCC1Q96CN9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GCC1Q96CN9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GCC1Q96CN9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GCC1Q96CN9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
GCC1Q96CN9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
GCC1Q96CN9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GCC1Q96CN9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
GCC1Q96CN9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
GCC1Q96CN9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.57■■■□□ 2.8
GCC1Q96CN9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GCC1Q96CN9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GCC1Q96CN9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GCC1Q96CN9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GCC1Q96CN9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GCC1Q96CN9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
GCC1Q96CN9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
GCC1Q96CN9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
GCC1Q96CN9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GCC1Q96CN9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
GCC1Q96CN9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
GCC1Q96CN9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
GCC1Q96CN9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
GCC1Q96CN9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
GCC1Q96CN9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
GCC1Q96CN9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
GCC1Q96CN9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
GCC1Q96CN9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
GCC1Q96CN9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
GCC1Q96CN9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GCC1Q96CN9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GCC1Q96CN9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GCC1Q96CN9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GCC1Q96CN9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GCC1Q96CN9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
GCC1Q96CN9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GCC1Q96CN9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GCC1Q96CN9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
GCC1Q96CN9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GCC1Q96CN9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms