Protein–RNA interactions for Protein: Q96BA8

CREB3L1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L1Q96BA8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3L1Q96BA8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3L1Q96BA8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3L1Q96BA8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CREB3L1Q96BA8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3L1Q96BA8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CREB3L1Q96BA8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CREB3L1Q96BA8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3L1Q96BA8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3L1Q96BA8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CREB3L1Q96BA8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3L1Q96BA8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3L1Q96BA8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3L1Q96BA8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CREB3L1Q96BA8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CREB3L1Q96BA8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB3L1Q96BA8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB3L1Q96BA8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB3L1Q96BA8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CREB3L1Q96BA8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3L1Q96BA8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3L1Q96BA8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CREB3L1Q96BA8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3L1Q96BA8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CREB3L1Q96BA8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB3L1Q96BA8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB3L1Q96BA8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CREB3L1Q96BA8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB3L1Q96BA8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CREB3L1Q96BA8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CREB3L1Q96BA8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3L1Q96BA8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3L1Q96BA8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3L1Q96BA8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3L1Q96BA8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3L1Q96BA8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CREB3L1Q96BA8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB3L1Q96BA8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CREB3L1Q96BA8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3L1Q96BA8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3L1Q96BA8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CREB3L1Q96BA8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3L1Q96BA8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CREB3L1Q96BA8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB3L1Q96BA8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB3L1Q96BA8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CREB3L1Q96BA8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L1Q96BA8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L1Q96BA8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CREB3L1Q96BA8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L1Q96BA8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L1Q96BA8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CREB3L1Q96BA8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3L1Q96BA8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3L1Q96BA8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3L1Q96BA8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CREB3L1Q96BA8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3L1Q96BA8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3L1Q96BA8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CREB3L1Q96BA8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CREB3L1Q96BA8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CREB3L1Q96BA8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3L1Q96BA8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3L1Q96BA8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3L1Q96BA8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3L1Q96BA8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L1Q96BA8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L1Q96BA8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L1Q96BA8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L1Q96BA8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3L1Q96BA8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3L1Q96BA8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3L1Q96BA8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3L1Q96BA8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3L1Q96BA8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3L1Q96BA8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3L1Q96BA8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB3L1Q96BA8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB3L1Q96BA8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB3L1Q96BA8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB3L1Q96BA8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB3L1Q96BA8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CREB3L1Q96BA8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CREB3L1Q96BA8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CREB3L1Q96BA8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3L1Q96BA8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3L1Q96BA8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3L1Q96BA8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB3L1Q96BA8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB3L1Q96BA8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB3L1Q96BA8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3L1Q96BA8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3L1Q96BA8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB3L1Q96BA8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CREB3L1Q96BA8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB3L1Q96BA8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB3L1Q96BA8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CREB3L1Q96BA8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CREB3L1Q96BA8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CREB3L1Q96BA8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms