Protein–RNA interactions for Protein: Q96A05

ATP6V1E2, V-type proton ATPase subunit E 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E2Q96A05 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP6V1E2Q96A05 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP6V1E2Q96A05 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP6V1E2Q96A05 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP6V1E2Q96A05 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP6V1E2Q96A05 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP6V1E2Q96A05 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP6V1E2Q96A05 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP6V1E2Q96A05 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP6V1E2Q96A05 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP6V1E2Q96A05 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP6V1E2Q96A05 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP6V1E2Q96A05 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP6V1E2Q96A05 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP6V1E2Q96A05 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP6V1E2Q96A05 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP6V1E2Q96A05 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP6V1E2Q96A05 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP6V1E2Q96A05 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP6V1E2Q96A05 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP6V1E2Q96A05 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP6V1E2Q96A05 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP6V1E2Q96A05 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP6V1E2Q96A05 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP6V1E2Q96A05 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP6V1E2Q96A05 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP6V1E2Q96A05 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP6V1E2Q96A05 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP6V1E2Q96A05 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP6V1E2Q96A05 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP6V1E2Q96A05 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP6V1E2Q96A05 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP6V1E2Q96A05 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP6V1E2Q96A05 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP6V1E2Q96A05 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP6V1E2Q96A05 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP6V1E2Q96A05 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP6V1E2Q96A05 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP6V1E2Q96A05 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP6V1E2Q96A05 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP6V1E2Q96A05 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP6V1E2Q96A05 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP6V1E2Q96A05 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP6V1E2Q96A05 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP6V1E2Q96A05 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP6V1E2Q96A05 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP6V1E2Q96A05 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP6V1E2Q96A05 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP6V1E2Q96A05 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP6V1E2Q96A05 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP6V1E2Q96A05 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP6V1E2Q96A05 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP6V1E2Q96A05 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP6V1E2Q96A05 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP6V1E2Q96A05 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP6V1E2Q96A05 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP6V1E2Q96A05 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP6V1E2Q96A05 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP6V1E2Q96A05 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP6V1E2Q96A05 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP6V1E2Q96A05 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP6V1E2Q96A05 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP6V1E2Q96A05 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP6V1E2Q96A05 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP6V1E2Q96A05 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP6V1E2Q96A05 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP6V1E2Q96A05 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP6V1E2Q96A05 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP6V1E2Q96A05 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP6V1E2Q96A05 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP6V1E2Q96A05 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP6V1E2Q96A05 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP6V1E2Q96A05 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP6V1E2Q96A05 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP6V1E2Q96A05 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP6V1E2Q96A05 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP6V1E2Q96A05 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP6V1E2Q96A05 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP6V1E2Q96A05 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP6V1E2Q96A05 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP6V1E2Q96A05 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP6V1E2Q96A05 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP6V1E2Q96A05 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP6V1E2Q96A05 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP6V1E2Q96A05 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP6V1E2Q96A05 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP6V1E2Q96A05 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP6V1E2Q96A05 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP6V1E2Q96A05 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP6V1E2Q96A05 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP6V1E2Q96A05 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP6V1E2Q96A05 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP6V1E2Q96A05 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP6V1E2Q96A05 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP6V1E2Q96A05 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP6V1E2Q96A05 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP6V1E2Q96A05 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP6V1E2Q96A05 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP6V1E2Q96A05 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP6V1E2Q96A05 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms