Protein–RNA interactions for Protein: Q969M2

GJA10, Gap junction alpha-10 protein, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA10Q969M2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GJA10Q969M2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GJA10Q969M2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
GJA10Q969M2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GJA10Q969M2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GJA10Q969M2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
GJA10Q969M2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GJA10Q969M2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GJA10Q969M2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
GJA10Q969M2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GJA10Q969M2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GJA10Q969M2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GJA10Q969M2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GJA10Q969M2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GJA10Q969M2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GJA10Q969M2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GJA10Q969M2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
GJA10Q969M2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GJA10Q969M2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GJA10Q969M2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GJA10Q969M2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GJA10Q969M2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GJA10Q969M2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GJA10Q969M2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GJA10Q969M2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GJA10Q969M2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GJA10Q969M2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GJA10Q969M2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GJA10Q969M2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
GJA10Q969M2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GJA10Q969M2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GJA10Q969M2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
GJA10Q969M2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GJA10Q969M2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GJA10Q969M2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GJA10Q969M2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GJA10Q969M2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GJA10Q969M2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GJA10Q969M2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GJA10Q969M2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GJA10Q969M2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
GJA10Q969M2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GJA10Q969M2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
GJA10Q969M2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GJA10Q969M2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GJA10Q969M2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GJA10Q969M2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GJA10Q969M2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GJA10Q969M2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GJA10Q969M2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GJA10Q969M2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GJA10Q969M2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GJA10Q969M2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GJA10Q969M2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GJA10Q969M2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GJA10Q969M2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GJA10Q969M2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GJA10Q969M2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GJA10Q969M2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GJA10Q969M2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
GJA10Q969M2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GJA10Q969M2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GJA10Q969M2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GJA10Q969M2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GJA10Q969M2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GJA10Q969M2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GJA10Q969M2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GJA10Q969M2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GJA10Q969M2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GJA10Q969M2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GJA10Q969M2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GJA10Q969M2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GJA10Q969M2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GJA10Q969M2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GJA10Q969M2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GJA10Q969M2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GJA10Q969M2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GJA10Q969M2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GJA10Q969M2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GJA10Q969M2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GJA10Q969M2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GJA10Q969M2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GJA10Q969M2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
GJA10Q969M2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GJA10Q969M2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
GJA10Q969M2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GJA10Q969M2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GJA10Q969M2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GJA10Q969M2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GJA10Q969M2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
GJA10Q969M2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GJA10Q969M2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GJA10Q969M2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GJA10Q969M2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GJA10Q969M2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GJA10Q969M2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GJA10Q969M2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GJA10Q969M2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GJA10Q969M2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GJA10Q969M2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms