Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
NEO1Q92859 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
NEO1Q92859 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
NEO1Q92859 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
NEO1Q92859 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
NEO1Q92859 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
NEO1Q92859 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
NEO1Q92859 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
NEO1Q92859 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
NEO1Q92859 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
NEO1Q92859 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.15
NEO1Q92859 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
NEO1Q92859 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC40.98■■■■■ 4.15
NEO1Q92859 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.96■■■■■ 4.15
NEO1Q92859 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
NEO1Q92859 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
NEO1Q92859 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
NEO1Q92859 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
NEO1Q92859 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
NEO1Q92859 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
NEO1Q92859 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.14
NEO1Q92859 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
NEO1Q92859 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
NEO1Q92859 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
NEO1Q92859 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
NEO1Q92859 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
NEO1Q92859 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
NEO1Q92859 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC40.87■■■■■ 4.13
NEO1Q92859 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
NEO1Q92859 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC40.86■■■■■ 4.13
NEO1Q92859 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
NEO1Q92859 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
NEO1Q92859 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
NEO1Q92859 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
NEO1Q92859 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
NEO1Q92859 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.12
NEO1Q92859 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
NEO1Q92859 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
NEO1Q92859 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
NEO1Q92859 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
NEO1Q92859 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
NEO1Q92859 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
NEO1Q92859 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
NEO1Q92859 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.11
NEO1Q92859 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
NEO1Q92859 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
NEO1Q92859 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
NEO1Q92859 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
NEO1Q92859 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
NEO1Q92859 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
NEO1Q92859 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
NEO1Q92859 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
NEO1Q92859 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
NEO1Q92859 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
NEO1Q92859 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
NEO1Q92859 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
NEO1Q92859 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC40.68■■■■■ 4.1
NEO1Q92859 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
NEO1Q92859 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
NEO1Q92859 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
NEO1Q92859 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC40.64■■■■■ 4.1
NEO1Q92859 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
NEO1Q92859 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
NEO1Q92859 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
NEO1Q92859 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
NEO1Q92859 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
NEO1Q92859 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
NEO1Q92859 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
NEO1Q92859 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
NEO1Q92859 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
NEO1Q92859 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
NEO1Q92859 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
NEO1Q92859 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC40.56■■■■■ 4.08
NEO1Q92859 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
NEO1Q92859 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
NEO1Q92859 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC40.54■■■■■ 4.08
NEO1Q92859 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
NEO1Q92859 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
NEO1Q92859 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
NEO1Q92859 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
NEO1Q92859 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
NEO1Q92859 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
NEO1Q92859 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
NEO1Q92859 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
NEO1Q92859 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC40.49■■■■■ 4.07
NEO1Q92859 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
NEO1Q92859 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
NEO1Q92859 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
NEO1Q92859 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
NEO1Q92859 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
NEO1Q92859 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC40.46■■■■■ 4.07
NEO1Q92859 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
NEO1Q92859 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
NEO1Q92859 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
NEO1Q92859 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
NEO1Q92859 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
NEO1Q92859 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
NEO1Q92859 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
NEO1Q92859 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
NEO1Q92859 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms