Protein–RNA interactions for Protein: Q92570

NR4A3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A3Q92570 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR4A3Q92570 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR4A3Q92570 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR4A3Q92570 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR4A3Q92570 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NR4A3Q92570 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR4A3Q92570 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR4A3Q92570 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR4A3Q92570 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR4A3Q92570 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR4A3Q92570 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NR4A3Q92570 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR4A3Q92570 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR4A3Q92570 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR4A3Q92570 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR4A3Q92570 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR4A3Q92570 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR4A3Q92570 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR4A3Q92570 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR4A3Q92570 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR4A3Q92570 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR4A3Q92570 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR4A3Q92570 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR4A3Q92570 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR4A3Q92570 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR4A3Q92570 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR4A3Q92570 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NR4A3Q92570 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR4A3Q92570 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR4A3Q92570 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR4A3Q92570 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR4A3Q92570 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR4A3Q92570 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR4A3Q92570 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR4A3Q92570 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR4A3Q92570 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR4A3Q92570 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR4A3Q92570 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR4A3Q92570 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NR4A3Q92570 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR4A3Q92570 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR4A3Q92570 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR4A3Q92570 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR4A3Q92570 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR4A3Q92570 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms