Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD9

CASKIN1, Caskin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN1Q8WXD9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
CASKIN1Q8WXD9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
CASKIN1Q8WXD9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
CASKIN1Q8WXD9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
CASKIN1Q8WXD9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
CASKIN1Q8WXD9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
CASKIN1Q8WXD9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.27
CASKIN1Q8WXD9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC41.74■■■■■ 4.27
CASKIN1Q8WXD9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
CASKIN1Q8WXD9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC41.73■■■■■ 4.27
CASKIN1Q8WXD9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
CASKIN1Q8WXD9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
CASKIN1Q8WXD9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC41.71■■■■■ 4.27
CASKIN1Q8WXD9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
CASKIN1Q8WXD9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
CASKIN1Q8WXD9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
CASKIN1Q8WXD9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
CASKIN1Q8WXD9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
CASKIN1Q8WXD9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
CASKIN1Q8WXD9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
CASKIN1Q8WXD9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
CASKIN1Q8WXD9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
CASKIN1Q8WXD9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
CASKIN1Q8WXD9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
CASKIN1Q8WXD9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC41.65■■■■■ 4.26
CASKIN1Q8WXD9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
CASKIN1Q8WXD9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC41.64■■■■■ 4.26
CASKIN1Q8WXD9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
CASKIN1Q8WXD9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
CASKIN1Q8WXD9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
CASKIN1Q8WXD9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
CASKIN1Q8WXD9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
CASKIN1Q8WXD9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
CASKIN1Q8WXD9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
CASKIN1Q8WXD9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
CASKIN1Q8WXD9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
CASKIN1Q8WXD9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
CASKIN1Q8WXD9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
CASKIN1Q8WXD9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
CASKIN1Q8WXD9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
CASKIN1Q8WXD9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
CASKIN1Q8WXD9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
CASKIN1Q8WXD9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
CASKIN1Q8WXD9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.52■■■■■ 4.24
CASKIN1Q8WXD9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
CASKIN1Q8WXD9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
CASKIN1Q8WXD9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.49■■■■■ 4.23
CASKIN1Q8WXD9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC41.49■■■■■ 4.23
CASKIN1Q8WXD9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
CASKIN1Q8WXD9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
CASKIN1Q8WXD9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
CASKIN1Q8WXD9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
CASKIN1Q8WXD9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
CASKIN1Q8WXD9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
CASKIN1Q8WXD9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
CASKIN1Q8WXD9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
CASKIN1Q8WXD9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
CASKIN1Q8WXD9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
CASKIN1Q8WXD9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
CASKIN1Q8WXD9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
CASKIN1Q8WXD9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
CASKIN1Q8WXD9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
CASKIN1Q8WXD9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
CASKIN1Q8WXD9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.23
CASKIN1Q8WXD9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC41.44■■■■■ 4.23
CASKIN1Q8WXD9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
CASKIN1Q8WXD9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
CASKIN1Q8WXD9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
CASKIN1Q8WXD9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
CASKIN1Q8WXD9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
CASKIN1Q8WXD9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
CASKIN1Q8WXD9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
CASKIN1Q8WXD9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
CASKIN1Q8WXD9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
CASKIN1Q8WXD9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
CASKIN1Q8WXD9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
CASKIN1Q8WXD9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.22
CASKIN1Q8WXD9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
CASKIN1Q8WXD9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
CASKIN1Q8WXD9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
CASKIN1Q8WXD9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
CASKIN1Q8WXD9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC41.36■■■■■ 4.21
CASKIN1Q8WXD9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
CASKIN1Q8WXD9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
CASKIN1Q8WXD9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
CASKIN1Q8WXD9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
CASKIN1Q8WXD9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
CASKIN1Q8WXD9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
CASKIN1Q8WXD9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
CASKIN1Q8WXD9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
CASKIN1Q8WXD9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
CASKIN1Q8WXD9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
CASKIN1Q8WXD9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
CASKIN1Q8WXD9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
CASKIN1Q8WXD9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
CASKIN1Q8WXD9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
CASKIN1Q8WXD9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
CASKIN1Q8WXD9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
CASKIN1Q8WXD9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC41.22■■■■■ 4.19
CASKIN1Q8WXD9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms