Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COPS9Q8WXC6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS9Q8WXC6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS9Q8WXC6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS9Q8WXC6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS9Q8WXC6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS9Q8WXC6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS9Q8WXC6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS9Q8WXC6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS9Q8WXC6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS9Q8WXC6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COPS9Q8WXC6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS9Q8WXC6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS9Q8WXC6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS9Q8WXC6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COPS9Q8WXC6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS9Q8WXC6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS9Q8WXC6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COPS9Q8WXC6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS9Q8WXC6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS9Q8WXC6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS9Q8WXC6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS9Q8WXC6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS9Q8WXC6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPS9Q8WXC6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPS9Q8WXC6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPS9Q8WXC6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS9Q8WXC6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS9Q8WXC6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS9Q8WXC6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS9Q8WXC6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS9Q8WXC6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS9Q8WXC6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS9Q8WXC6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPS9Q8WXC6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPS9Q8WXC6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPS9Q8WXC6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPS9Q8WXC6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPS9Q8WXC6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPS9Q8WXC6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPS9Q8WXC6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPS9Q8WXC6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPS9Q8WXC6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPS9Q8WXC6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPS9Q8WXC6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPS9Q8WXC6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPS9Q8WXC6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS9Q8WXC6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS9Q8WXC6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS9Q8WXC6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS9Q8WXC6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS9Q8WXC6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS9Q8WXC6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPS9Q8WXC6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS9Q8WXC6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS9Q8WXC6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COPS9Q8WXC6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS9Q8WXC6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS9Q8WXC6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS9Q8WXC6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS9Q8WXC6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS9Q8WXC6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPS9Q8WXC6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPS9Q8WXC6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPS9Q8WXC6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPS9Q8WXC6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPS9Q8WXC6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPS9Q8WXC6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COPS9Q8WXC6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COPS9Q8WXC6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COPS9Q8WXC6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COPS9Q8WXC6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COPS9Q8WXC6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COPS9Q8WXC6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COPS9Q8WXC6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COPS9Q8WXC6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COPS9Q8WXC6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
COPS9Q8WXC6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS9Q8WXC6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS9Q8WXC6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS9Q8WXC6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS9Q8WXC6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS9Q8WXC6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS9Q8WXC6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS9Q8WXC6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS9Q8WXC6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS9Q8WXC6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS9Q8WXC6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS9Q8WXC6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS9Q8WXC6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS9Q8WXC6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS9Q8WXC6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS9Q8WXC6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS9Q8WXC6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS9Q8WXC6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS9Q8WXC6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS9Q8WXC6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS9Q8WXC6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS9Q8WXC6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS9Q8WXC6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms