Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWZ7

ABCA5, ATP-binding cassette sub-family A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA5Q8WWZ7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC44.6■■■■■ 4.73
ABCA5Q8WWZ7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
ABCA5Q8WWZ7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC44.59■■■■■ 4.73
ABCA5Q8WWZ7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.72
ABCA5Q8WWZ7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
ABCA5Q8WWZ7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
ABCA5Q8WWZ7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
ABCA5Q8WWZ7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC44.48■■■■■ 4.71
ABCA5Q8WWZ7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.46■■■■■ 4.71
ABCA5Q8WWZ7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
ABCA5Q8WWZ7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
ABCA5Q8WWZ7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
ABCA5Q8WWZ7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.71
ABCA5Q8WWZ7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
ABCA5Q8WWZ7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
ABCA5Q8WWZ7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC44.42■■■■■ 4.7
ABCA5Q8WWZ7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
ABCA5Q8WWZ7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC44.42■■■■■ 4.7
ABCA5Q8WWZ7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC44.39■■■■■ 4.7
ABCA5Q8WWZ7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
ABCA5Q8WWZ7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC44.38■■■■■ 4.69
ABCA5Q8WWZ7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC44.37■■■■■ 4.69
ABCA5Q8WWZ7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC44.37■■■■■ 4.69
ABCA5Q8WWZ7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
ABCA5Q8WWZ7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC44.36■■■■■ 4.69
ABCA5Q8WWZ7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
ABCA5Q8WWZ7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
ABCA5Q8WWZ7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC44.34■■■■■ 4.69
ABCA5Q8WWZ7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
ABCA5Q8WWZ7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
ABCA5Q8WWZ7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
ABCA5Q8WWZ7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
ABCA5Q8WWZ7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
ABCA5Q8WWZ7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
ABCA5Q8WWZ7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
ABCA5Q8WWZ7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
ABCA5Q8WWZ7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC44.31■■■■■ 4.68
ABCA5Q8WWZ7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC44.3■■■■■ 4.68
ABCA5Q8WWZ7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.3■■■■■ 4.68
ABCA5Q8WWZ7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.3■■■■■ 4.68
ABCA5Q8WWZ7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC44.28■■■■■ 4.68
ABCA5Q8WWZ7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
ABCA5Q8WWZ7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
ABCA5Q8WWZ7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
ABCA5Q8WWZ7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.2■■■■■ 4.67
ABCA5Q8WWZ7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
ABCA5Q8WWZ7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC44.2■■■■■ 4.67
ABCA5Q8WWZ7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC44.18■■■■■ 4.66
ABCA5Q8WWZ7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
ABCA5Q8WWZ7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC44.17■■■■■ 4.66
ABCA5Q8WWZ7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
ABCA5Q8WWZ7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
ABCA5Q8WWZ7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
ABCA5Q8WWZ7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC44.16■■■■■ 4.66
ABCA5Q8WWZ7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
ABCA5Q8WWZ7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC44.15■■■■■ 4.66
ABCA5Q8WWZ7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
ABCA5Q8WWZ7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
ABCA5Q8WWZ7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.66
ABCA5Q8WWZ7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.66
ABCA5Q8WWZ7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.13■■■■■ 4.65
ABCA5Q8WWZ7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
ABCA5Q8WWZ7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC44.12■■■■■ 4.65
ABCA5Q8WWZ7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC44.11■■■■■ 4.65
ABCA5Q8WWZ7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
ABCA5Q8WWZ7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
ABCA5Q8WWZ7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC44.1■■■■■ 4.65
ABCA5Q8WWZ7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
ABCA5Q8WWZ7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC44.09■■■■■ 4.65
ABCA5Q8WWZ7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC44.09■■■■■ 4.65
ABCA5Q8WWZ7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC44.06■■■■■ 4.64
ABCA5Q8WWZ7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
ABCA5Q8WWZ7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC44.04■■■■■ 4.64
ABCA5Q8WWZ7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
ABCA5Q8WWZ7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
ABCA5Q8WWZ7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC44.02■■■■■ 4.64
ABCA5Q8WWZ7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC44.02■■■■■ 4.64
ABCA5Q8WWZ7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
ABCA5Q8WWZ7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
ABCA5Q8WWZ7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
ABCA5Q8WWZ7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC43.99■■■■■ 4.63
ABCA5Q8WWZ7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC43.98■■■■■ 4.63
ABCA5Q8WWZ7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
ABCA5Q8WWZ7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
ABCA5Q8WWZ7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
ABCA5Q8WWZ7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC43.95■■■■■ 4.63
ABCA5Q8WWZ7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC43.94■■■■■ 4.62
ABCA5Q8WWZ7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
ABCA5Q8WWZ7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC43.94■■■■■ 4.62
ABCA5Q8WWZ7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
ABCA5Q8WWZ7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
ABCA5Q8WWZ7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC43.91■■■■■ 4.62
ABCA5Q8WWZ7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
ABCA5Q8WWZ7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.9■■■■■ 4.62
ABCA5Q8WWZ7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
ABCA5Q8WWZ7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC43.9■■■■■ 4.62
ABCA5Q8WWZ7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.89■■■■■ 4.62
ABCA5Q8WWZ7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC43.88■■■■■ 4.61
ABCA5Q8WWZ7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
ABCA5Q8WWZ7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC43.87■■■■■ 4.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms