Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEC5

SH3RF2, Putative E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF2, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF2Q8TEC5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SH3RF2Q8TEC5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SH3RF2Q8TEC5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SH3RF2Q8TEC5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SH3RF2Q8TEC5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SH3RF2Q8TEC5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SH3RF2Q8TEC5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SH3RF2Q8TEC5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SH3RF2Q8TEC5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SH3RF2Q8TEC5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SH3RF2Q8TEC5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SH3RF2Q8TEC5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SH3RF2Q8TEC5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SH3RF2Q8TEC5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SH3RF2Q8TEC5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SH3RF2Q8TEC5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SH3RF2Q8TEC5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SH3RF2Q8TEC5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SH3RF2Q8TEC5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SH3RF2Q8TEC5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SH3RF2Q8TEC5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SH3RF2Q8TEC5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SH3RF2Q8TEC5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SH3RF2Q8TEC5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SH3RF2Q8TEC5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SH3RF2Q8TEC5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SH3RF2Q8TEC5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SH3RF2Q8TEC5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SH3RF2Q8TEC5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SH3RF2Q8TEC5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SH3RF2Q8TEC5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SH3RF2Q8TEC5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SH3RF2Q8TEC5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SH3RF2Q8TEC5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SH3RF2Q8TEC5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SH3RF2Q8TEC5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SH3RF2Q8TEC5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SH3RF2Q8TEC5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SH3RF2Q8TEC5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SH3RF2Q8TEC5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SH3RF2Q8TEC5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SH3RF2Q8TEC5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SH3RF2Q8TEC5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SH3RF2Q8TEC5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SH3RF2Q8TEC5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SH3RF2Q8TEC5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SH3RF2Q8TEC5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SH3RF2Q8TEC5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SH3RF2Q8TEC5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SH3RF2Q8TEC5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SH3RF2Q8TEC5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SH3RF2Q8TEC5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SH3RF2Q8TEC5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SH3RF2Q8TEC5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SH3RF2Q8TEC5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SH3RF2Q8TEC5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SH3RF2Q8TEC5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SH3RF2Q8TEC5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SH3RF2Q8TEC5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SH3RF2Q8TEC5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SH3RF2Q8TEC5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SH3RF2Q8TEC5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SH3RF2Q8TEC5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH3RF2Q8TEC5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SH3RF2Q8TEC5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SH3RF2Q8TEC5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SH3RF2Q8TEC5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SH3RF2Q8TEC5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SH3RF2Q8TEC5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SH3RF2Q8TEC5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3RF2Q8TEC5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3RF2Q8TEC5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3RF2Q8TEC5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3RF2Q8TEC5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3RF2Q8TEC5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3RF2Q8TEC5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SH3RF2Q8TEC5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SH3RF2Q8TEC5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SH3RF2Q8TEC5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SH3RF2Q8TEC5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SH3RF2Q8TEC5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH3RF2Q8TEC5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SH3RF2Q8TEC5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH3RF2Q8TEC5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH3RF2Q8TEC5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH3RF2Q8TEC5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SH3RF2Q8TEC5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SH3RF2Q8TEC5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SH3RF2Q8TEC5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SH3RF2Q8TEC5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SH3RF2Q8TEC5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SH3RF2Q8TEC5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SH3RF2Q8TEC5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SH3RF2Q8TEC5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SH3RF2Q8TEC5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SH3RF2Q8TEC5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SH3RF2Q8TEC5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SH3RF2Q8TEC5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SH3RF2Q8TEC5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SH3RF2Q8TEC5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms