Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD06

AGR3, Anterior gradient protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGR3Q8TD06 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGR3Q8TD06 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGR3Q8TD06 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGR3Q8TD06 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGR3Q8TD06 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGR3Q8TD06 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGR3Q8TD06 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGR3Q8TD06 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
AGR3Q8TD06 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGR3Q8TD06 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
AGR3Q8TD06 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
AGR3Q8TD06 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGR3Q8TD06 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGR3Q8TD06 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGR3Q8TD06 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGR3Q8TD06 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGR3Q8TD06 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGR3Q8TD06 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGR3Q8TD06 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGR3Q8TD06 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGR3Q8TD06 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGR3Q8TD06 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGR3Q8TD06 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGR3Q8TD06 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AGR3Q8TD06 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AGR3Q8TD06 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AGR3Q8TD06 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AGR3Q8TD06 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AGR3Q8TD06 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AGR3Q8TD06 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AGR3Q8TD06 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
AGR3Q8TD06 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AGR3Q8TD06 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AGR3Q8TD06 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGR3Q8TD06 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGR3Q8TD06 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGR3Q8TD06 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
AGR3Q8TD06 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGR3Q8TD06 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGR3Q8TD06 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGR3Q8TD06 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGR3Q8TD06 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AGR3Q8TD06 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AGR3Q8TD06 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AGR3Q8TD06 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AGR3Q8TD06 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AGR3Q8TD06 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AGR3Q8TD06 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AGR3Q8TD06 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AGR3Q8TD06 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AGR3Q8TD06 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AGR3Q8TD06 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AGR3Q8TD06 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AGR3Q8TD06 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AGR3Q8TD06 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AGR3Q8TD06 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AGR3Q8TD06 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AGR3Q8TD06 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AGR3Q8TD06 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
AGR3Q8TD06 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AGR3Q8TD06 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AGR3Q8TD06 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AGR3Q8TD06 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AGR3Q8TD06 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AGR3Q8TD06 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AGR3Q8TD06 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AGR3Q8TD06 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AGR3Q8TD06 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGR3Q8TD06 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGR3Q8TD06 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGR3Q8TD06 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGR3Q8TD06 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGR3Q8TD06 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGR3Q8TD06 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGR3Q8TD06 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGR3Q8TD06 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGR3Q8TD06 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGR3Q8TD06 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
AGR3Q8TD06 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AGR3Q8TD06 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGR3Q8TD06 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGR3Q8TD06 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGR3Q8TD06 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGR3Q8TD06 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGR3Q8TD06 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGR3Q8TD06 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGR3Q8TD06 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGR3Q8TD06 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGR3Q8TD06 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGR3Q8TD06 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGR3Q8TD06 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGR3Q8TD06 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AGR3Q8TD06 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AGR3Q8TD06 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AGR3Q8TD06 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
AGR3Q8TD06 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AGR3Q8TD06 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGR3Q8TD06 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGR3Q8TD06 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGR3Q8TD06 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms