Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP9

ZNF555, Zinc finger protein 555, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF555Q8NEP9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF555Q8NEP9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF555Q8NEP9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF555Q8NEP9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF555Q8NEP9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF555Q8NEP9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF555Q8NEP9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF555Q8NEP9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF555Q8NEP9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF555Q8NEP9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF555Q8NEP9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF555Q8NEP9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF555Q8NEP9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF555Q8NEP9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF555Q8NEP9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF555Q8NEP9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF555Q8NEP9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF555Q8NEP9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF555Q8NEP9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF555Q8NEP9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF555Q8NEP9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF555Q8NEP9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF555Q8NEP9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF555Q8NEP9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF555Q8NEP9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF555Q8NEP9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF555Q8NEP9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF555Q8NEP9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF555Q8NEP9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF555Q8NEP9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF555Q8NEP9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF555Q8NEP9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF555Q8NEP9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF555Q8NEP9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF555Q8NEP9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF555Q8NEP9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF555Q8NEP9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF555Q8NEP9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF555Q8NEP9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF555Q8NEP9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF555Q8NEP9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF555Q8NEP9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF555Q8NEP9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF555Q8NEP9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF555Q8NEP9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF555Q8NEP9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF555Q8NEP9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF555Q8NEP9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF555Q8NEP9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF555Q8NEP9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF555Q8NEP9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF555Q8NEP9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF555Q8NEP9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF555Q8NEP9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF555Q8NEP9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF555Q8NEP9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF555Q8NEP9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF555Q8NEP9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF555Q8NEP9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF555Q8NEP9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF555Q8NEP9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF555Q8NEP9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF555Q8NEP9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF555Q8NEP9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF555Q8NEP9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF555Q8NEP9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF555Q8NEP9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF555Q8NEP9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF555Q8NEP9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF555Q8NEP9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF555Q8NEP9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF555Q8NEP9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF555Q8NEP9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF555Q8NEP9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF555Q8NEP9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF555Q8NEP9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF555Q8NEP9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF555Q8NEP9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF555Q8NEP9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF555Q8NEP9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF555Q8NEP9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF555Q8NEP9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF555Q8NEP9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF555Q8NEP9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF555Q8NEP9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF555Q8NEP9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF555Q8NEP9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF555Q8NEP9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF555Q8NEP9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF555Q8NEP9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF555Q8NEP9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF555Q8NEP9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF555Q8NEP9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF555Q8NEP9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF555Q8NEP9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF555Q8NEP9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF555Q8NEP9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF555Q8NEP9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF555Q8NEP9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF555Q8NEP9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms