Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF248Q8NDW4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF248Q8NDW4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF248Q8NDW4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF248Q8NDW4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF248Q8NDW4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF248Q8NDW4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF248Q8NDW4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF248Q8NDW4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF248Q8NDW4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF248Q8NDW4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF248Q8NDW4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF248Q8NDW4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF248Q8NDW4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF248Q8NDW4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF248Q8NDW4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF248Q8NDW4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF248Q8NDW4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF248Q8NDW4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF248Q8NDW4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF248Q8NDW4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF248Q8NDW4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF248Q8NDW4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF248Q8NDW4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF248Q8NDW4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF248Q8NDW4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF248Q8NDW4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF248Q8NDW4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF248Q8NDW4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF248Q8NDW4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF248Q8NDW4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF248Q8NDW4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF248Q8NDW4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF248Q8NDW4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF248Q8NDW4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF248Q8NDW4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF248Q8NDW4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF248Q8NDW4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms