Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF248Q8NDW4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF248Q8NDW4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF248Q8NDW4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF248Q8NDW4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF248Q8NDW4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF248Q8NDW4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF248Q8NDW4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF248Q8NDW4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF248Q8NDW4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF248Q8NDW4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF248Q8NDW4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF248Q8NDW4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF248Q8NDW4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF248Q8NDW4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF248Q8NDW4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF248Q8NDW4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF248Q8NDW4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF248Q8NDW4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF248Q8NDW4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF248Q8NDW4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF248Q8NDW4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF248Q8NDW4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF248Q8NDW4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF248Q8NDW4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF248Q8NDW4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF248Q8NDW4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF248Q8NDW4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF248Q8NDW4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF248Q8NDW4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF248Q8NDW4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF248Q8NDW4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF248Q8NDW4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF248Q8NDW4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF248Q8NDW4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF248Q8NDW4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF248Q8NDW4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF248Q8NDW4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF248Q8NDW4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF248Q8NDW4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF248Q8NDW4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
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