Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF439Q8NDP4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF439Q8NDP4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF439Q8NDP4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF439Q8NDP4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF439Q8NDP4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF439Q8NDP4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF439Q8NDP4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF439Q8NDP4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF439Q8NDP4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF439Q8NDP4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF439Q8NDP4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF439Q8NDP4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF439Q8NDP4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF439Q8NDP4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF439Q8NDP4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF439Q8NDP4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF439Q8NDP4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF439Q8NDP4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF439Q8NDP4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF439Q8NDP4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF439Q8NDP4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF439Q8NDP4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF439Q8NDP4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF439Q8NDP4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF439Q8NDP4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF439Q8NDP4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF439Q8NDP4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF439Q8NDP4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF439Q8NDP4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF439Q8NDP4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF439Q8NDP4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF439Q8NDP4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF439Q8NDP4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF439Q8NDP4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF439Q8NDP4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF439Q8NDP4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF439Q8NDP4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF439Q8NDP4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF439Q8NDP4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF439Q8NDP4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF439Q8NDP4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF439Q8NDP4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF439Q8NDP4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF439Q8NDP4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF439Q8NDP4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF439Q8NDP4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF439Q8NDP4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF439Q8NDP4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF439Q8NDP4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF439Q8NDP4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF439Q8NDP4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF439Q8NDP4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF439Q8NDP4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF439Q8NDP4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF439Q8NDP4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF439Q8NDP4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF439Q8NDP4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF439Q8NDP4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF439Q8NDP4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF439Q8NDP4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF439Q8NDP4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF439Q8NDP4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF439Q8NDP4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF439Q8NDP4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF439Q8NDP4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF439Q8NDP4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF439Q8NDP4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF439Q8NDP4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF439Q8NDP4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF439Q8NDP4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF439Q8NDP4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF439Q8NDP4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF439Q8NDP4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF439Q8NDP4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF439Q8NDP4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF439Q8NDP4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF439Q8NDP4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF439Q8NDP4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF439Q8NDP4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF439Q8NDP4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF439Q8NDP4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF439Q8NDP4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF439Q8NDP4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF439Q8NDP4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF439Q8NDP4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF439Q8NDP4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF439Q8NDP4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF439Q8NDP4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF439Q8NDP4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF439Q8NDP4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF439Q8NDP4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF439Q8NDP4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF439Q8NDP4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF439Q8NDP4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF439Q8NDP4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF439Q8NDP4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF439Q8NDP4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF439Q8NDP4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF439Q8NDP4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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