Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDI1

EHBP1, EH domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHBP1Q8NDI1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EHBP1Q8NDI1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EHBP1Q8NDI1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EHBP1Q8NDI1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EHBP1Q8NDI1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EHBP1Q8NDI1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EHBP1Q8NDI1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EHBP1Q8NDI1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EHBP1Q8NDI1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EHBP1Q8NDI1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EHBP1Q8NDI1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EHBP1Q8NDI1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EHBP1Q8NDI1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EHBP1Q8NDI1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EHBP1Q8NDI1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EHBP1Q8NDI1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EHBP1Q8NDI1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EHBP1Q8NDI1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EHBP1Q8NDI1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EHBP1Q8NDI1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EHBP1Q8NDI1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EHBP1Q8NDI1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EHBP1Q8NDI1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EHBP1Q8NDI1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EHBP1Q8NDI1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EHBP1Q8NDI1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EHBP1Q8NDI1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EHBP1Q8NDI1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EHBP1Q8NDI1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EHBP1Q8NDI1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EHBP1Q8NDI1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EHBP1Q8NDI1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EHBP1Q8NDI1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EHBP1Q8NDI1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EHBP1Q8NDI1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EHBP1Q8NDI1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EHBP1Q8NDI1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EHBP1Q8NDI1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EHBP1Q8NDI1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EHBP1Q8NDI1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EHBP1Q8NDI1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EHBP1Q8NDI1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EHBP1Q8NDI1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EHBP1Q8NDI1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EHBP1Q8NDI1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EHBP1Q8NDI1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EHBP1Q8NDI1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EHBP1Q8NDI1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
EHBP1Q8NDI1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EHBP1Q8NDI1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
EHBP1Q8NDI1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EHBP1Q8NDI1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EHBP1Q8NDI1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EHBP1Q8NDI1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EHBP1Q8NDI1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EHBP1Q8NDI1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EHBP1Q8NDI1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EHBP1Q8NDI1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EHBP1Q8NDI1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EHBP1Q8NDI1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EHBP1Q8NDI1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EHBP1Q8NDI1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EHBP1Q8NDI1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
EHBP1Q8NDI1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
EHBP1Q8NDI1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EHBP1Q8NDI1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EHBP1Q8NDI1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EHBP1Q8NDI1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EHBP1Q8NDI1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EHBP1Q8NDI1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EHBP1Q8NDI1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EHBP1Q8NDI1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EHBP1Q8NDI1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EHBP1Q8NDI1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EHBP1Q8NDI1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EHBP1Q8NDI1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EHBP1Q8NDI1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EHBP1Q8NDI1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EHBP1Q8NDI1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EHBP1Q8NDI1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EHBP1Q8NDI1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EHBP1Q8NDI1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EHBP1Q8NDI1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EHBP1Q8NDI1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EHBP1Q8NDI1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EHBP1Q8NDI1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EHBP1Q8NDI1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EHBP1Q8NDI1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EHBP1Q8NDI1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EHBP1Q8NDI1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EHBP1Q8NDI1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EHBP1Q8NDI1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EHBP1Q8NDI1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EHBP1Q8NDI1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EHBP1Q8NDI1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EHBP1Q8NDI1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EHBP1Q8NDI1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EHBP1Q8NDI1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EHBP1Q8NDI1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EHBP1Q8NDI1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms