Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCC5

SLC37A3, Sugar phosphate exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC37A3Q8NCC5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC37A3Q8NCC5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC37A3Q8NCC5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC37A3Q8NCC5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC37A3Q8NCC5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC37A3Q8NCC5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC37A3Q8NCC5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC37A3Q8NCC5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC37A3Q8NCC5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC37A3Q8NCC5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC37A3Q8NCC5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC37A3Q8NCC5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC37A3Q8NCC5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC37A3Q8NCC5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC37A3Q8NCC5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC37A3Q8NCC5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC37A3Q8NCC5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC37A3Q8NCC5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC37A3Q8NCC5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC37A3Q8NCC5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC37A3Q8NCC5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC37A3Q8NCC5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC37A3Q8NCC5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC37A3Q8NCC5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC37A3Q8NCC5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC37A3Q8NCC5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC37A3Q8NCC5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC37A3Q8NCC5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC37A3Q8NCC5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC37A3Q8NCC5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC37A3Q8NCC5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC37A3Q8NCC5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC37A3Q8NCC5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC37A3Q8NCC5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC37A3Q8NCC5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC37A3Q8NCC5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC37A3Q8NCC5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC37A3Q8NCC5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC37A3Q8NCC5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC37A3Q8NCC5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC37A3Q8NCC5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC37A3Q8NCC5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC37A3Q8NCC5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC37A3Q8NCC5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC37A3Q8NCC5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC37A3Q8NCC5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC37A3Q8NCC5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC37A3Q8NCC5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC37A3Q8NCC5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC37A3Q8NCC5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC37A3Q8NCC5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC37A3Q8NCC5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC37A3Q8NCC5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC37A3Q8NCC5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC37A3Q8NCC5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC37A3Q8NCC5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC37A3Q8NCC5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC37A3Q8NCC5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC37A3Q8NCC5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC37A3Q8NCC5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC37A3Q8NCC5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC37A3Q8NCC5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC37A3Q8NCC5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC37A3Q8NCC5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC37A3Q8NCC5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC37A3Q8NCC5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC37A3Q8NCC5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC37A3Q8NCC5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC37A3Q8NCC5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC37A3Q8NCC5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC37A3Q8NCC5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC37A3Q8NCC5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC37A3Q8NCC5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC37A3Q8NCC5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC37A3Q8NCC5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC37A3Q8NCC5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC37A3Q8NCC5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC37A3Q8NCC5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC37A3Q8NCC5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC37A3Q8NCC5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC37A3Q8NCC5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC37A3Q8NCC5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC37A3Q8NCC5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC37A3Q8NCC5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC37A3Q8NCC5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC37A3Q8NCC5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC37A3Q8NCC5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC37A3Q8NCC5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC37A3Q8NCC5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC37A3Q8NCC5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC37A3Q8NCC5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC37A3Q8NCC5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC37A3Q8NCC5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC37A3Q8NCC5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC37A3Q8NCC5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC37A3Q8NCC5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC37A3Q8NCC5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC37A3Q8NCC5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC37A3Q8NCC5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC37A3Q8NCC5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms