Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COLGALT1Q8NBJ5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
COLGALT1Q8NBJ5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COLGALT1Q8NBJ5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COLGALT1Q8NBJ5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COLGALT1Q8NBJ5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COLGALT1Q8NBJ5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COLGALT1Q8NBJ5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COLGALT1Q8NBJ5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COLGALT1Q8NBJ5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COLGALT1Q8NBJ5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COLGALT1Q8NBJ5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COLGALT1Q8NBJ5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COLGALT1Q8NBJ5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COLGALT1Q8NBJ5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COLGALT1Q8NBJ5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COLGALT1Q8NBJ5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
COLGALT1Q8NBJ5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COLGALT1Q8NBJ5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COLGALT1Q8NBJ5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COLGALT1Q8NBJ5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COLGALT1Q8NBJ5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COLGALT1Q8NBJ5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COLGALT1Q8NBJ5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COLGALT1Q8NBJ5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COLGALT1Q8NBJ5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COLGALT1Q8NBJ5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COLGALT1Q8NBJ5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COLGALT1Q8NBJ5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COLGALT1Q8NBJ5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COLGALT1Q8NBJ5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COLGALT1Q8NBJ5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COLGALT1Q8NBJ5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
COLGALT1Q8NBJ5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
COLGALT1Q8NBJ5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
COLGALT1Q8NBJ5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
COLGALT1Q8NBJ5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
COLGALT1Q8NBJ5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
COLGALT1Q8NBJ5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
COLGALT1Q8NBJ5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
COLGALT1Q8NBJ5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
COLGALT1Q8NBJ5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COLGALT1Q8NBJ5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COLGALT1Q8NBJ5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COLGALT1Q8NBJ5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COLGALT1Q8NBJ5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COLGALT1Q8NBJ5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COLGALT1Q8NBJ5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
COLGALT1Q8NBJ5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COLGALT1Q8NBJ5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COLGALT1Q8NBJ5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
COLGALT1Q8NBJ5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COLGALT1Q8NBJ5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COLGALT1Q8NBJ5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COLGALT1Q8NBJ5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COLGALT1Q8NBJ5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COLGALT1Q8NBJ5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COLGALT1Q8NBJ5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
COLGALT1Q8NBJ5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COLGALT1Q8NBJ5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COLGALT1Q8NBJ5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COLGALT1Q8NBJ5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COLGALT1Q8NBJ5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COLGALT1Q8NBJ5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COLGALT1Q8NBJ5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COLGALT1Q8NBJ5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COLGALT1Q8NBJ5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COLGALT1Q8NBJ5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COLGALT1Q8NBJ5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COLGALT1Q8NBJ5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COLGALT1Q8NBJ5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COLGALT1Q8NBJ5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COLGALT1Q8NBJ5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COLGALT1Q8NBJ5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COLGALT1Q8NBJ5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COLGALT1Q8NBJ5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COLGALT1Q8NBJ5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COLGALT1Q8NBJ5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COLGALT1Q8NBJ5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COLGALT1Q8NBJ5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COLGALT1Q8NBJ5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COLGALT1Q8NBJ5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COLGALT1Q8NBJ5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
COLGALT1Q8NBJ5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
COLGALT1Q8NBJ5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COLGALT1Q8NBJ5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
COLGALT1Q8NBJ5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COLGALT1Q8NBJ5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COLGALT1Q8NBJ5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COLGALT1Q8NBJ5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
COLGALT1Q8NBJ5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COLGALT1Q8NBJ5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
COLGALT1Q8NBJ5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COLGALT1Q8NBJ5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
COLGALT1Q8NBJ5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
COLGALT1Q8NBJ5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COLGALT1Q8NBJ5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COLGALT1Q8NBJ5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COLGALT1Q8NBJ5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms