Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FSIP1Q8NA03 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FSIP1Q8NA03 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FSIP1Q8NA03 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FSIP1Q8NA03 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FSIP1Q8NA03 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FSIP1Q8NA03 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FSIP1Q8NA03 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FSIP1Q8NA03 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
FSIP1Q8NA03 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FSIP1Q8NA03 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FSIP1Q8NA03 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
FSIP1Q8NA03 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FSIP1Q8NA03 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FSIP1Q8NA03 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
FSIP1Q8NA03 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FSIP1Q8NA03 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FSIP1Q8NA03 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FSIP1Q8NA03 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FSIP1Q8NA03 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FSIP1Q8NA03 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FSIP1Q8NA03 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
FSIP1Q8NA03 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FSIP1Q8NA03 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
FSIP1Q8NA03 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FSIP1Q8NA03 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FSIP1Q8NA03 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FSIP1Q8NA03 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FSIP1Q8NA03 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FSIP1Q8NA03 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FSIP1Q8NA03 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FSIP1Q8NA03 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FSIP1Q8NA03 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FSIP1Q8NA03 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FSIP1Q8NA03 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FSIP1Q8NA03 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FSIP1Q8NA03 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FSIP1Q8NA03 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FSIP1Q8NA03 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FSIP1Q8NA03 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FSIP1Q8NA03 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FSIP1Q8NA03 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FSIP1Q8NA03 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FSIP1Q8NA03 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FSIP1Q8NA03 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FSIP1Q8NA03 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FSIP1Q8NA03 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FSIP1Q8NA03 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FSIP1Q8NA03 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FSIP1Q8NA03 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FSIP1Q8NA03 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
FSIP1Q8NA03 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FSIP1Q8NA03 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FSIP1Q8NA03 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FSIP1Q8NA03 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FSIP1Q8NA03 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FSIP1Q8NA03 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FSIP1Q8NA03 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
FSIP1Q8NA03 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
FSIP1Q8NA03 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
FSIP1Q8NA03 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
FSIP1Q8NA03 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FSIP1Q8NA03 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FSIP1Q8NA03 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FSIP1Q8NA03 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FSIP1Q8NA03 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FSIP1Q8NA03 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FSIP1Q8NA03 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FSIP1Q8NA03 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FSIP1Q8NA03 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FSIP1Q8NA03 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FSIP1Q8NA03 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FSIP1Q8NA03 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FSIP1Q8NA03 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FSIP1Q8NA03 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FSIP1Q8NA03 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FSIP1Q8NA03 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FSIP1Q8NA03 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FSIP1Q8NA03 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FSIP1Q8NA03 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FSIP1Q8NA03 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FSIP1Q8NA03 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FSIP1Q8NA03 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FSIP1Q8NA03 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FSIP1Q8NA03 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FSIP1Q8NA03 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FSIP1Q8NA03 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FSIP1Q8NA03 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
FSIP1Q8NA03 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FSIP1Q8NA03 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FSIP1Q8NA03 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FSIP1Q8NA03 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FSIP1Q8NA03 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FSIP1Q8NA03 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FSIP1Q8NA03 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FSIP1Q8NA03 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FSIP1Q8NA03 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FSIP1Q8NA03 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
FSIP1Q8NA03 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
FSIP1Q8NA03 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms