Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8D1

PDCD7, Programmed cell death protein 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD7Q8N8D1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDCD7Q8N8D1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDCD7Q8N8D1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDCD7Q8N8D1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PDCD7Q8N8D1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDCD7Q8N8D1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDCD7Q8N8D1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PDCD7Q8N8D1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PDCD7Q8N8D1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDCD7Q8N8D1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDCD7Q8N8D1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDCD7Q8N8D1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDCD7Q8N8D1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDCD7Q8N8D1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDCD7Q8N8D1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDCD7Q8N8D1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDCD7Q8N8D1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDCD7Q8N8D1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDCD7Q8N8D1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDCD7Q8N8D1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDCD7Q8N8D1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDCD7Q8N8D1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDCD7Q8N8D1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDCD7Q8N8D1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDCD7Q8N8D1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDCD7Q8N8D1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDCD7Q8N8D1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDCD7Q8N8D1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDCD7Q8N8D1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDCD7Q8N8D1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDCD7Q8N8D1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDCD7Q8N8D1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDCD7Q8N8D1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDCD7Q8N8D1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDCD7Q8N8D1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDCD7Q8N8D1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PDCD7Q8N8D1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDCD7Q8N8D1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDCD7Q8N8D1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
PDCD7Q8N8D1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDCD7Q8N8D1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDCD7Q8N8D1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDCD7Q8N8D1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDCD7Q8N8D1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDCD7Q8N8D1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDCD7Q8N8D1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDCD7Q8N8D1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDCD7Q8N8D1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDCD7Q8N8D1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDCD7Q8N8D1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDCD7Q8N8D1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDCD7Q8N8D1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDCD7Q8N8D1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDCD7Q8N8D1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDCD7Q8N8D1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCD7Q8N8D1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCD7Q8N8D1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCD7Q8N8D1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCD7Q8N8D1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCD7Q8N8D1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDCD7Q8N8D1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PDCD7Q8N8D1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDCD7Q8N8D1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDCD7Q8N8D1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDCD7Q8N8D1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDCD7Q8N8D1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDCD7Q8N8D1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDCD7Q8N8D1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDCD7Q8N8D1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PDCD7Q8N8D1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDCD7Q8N8D1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDCD7Q8N8D1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDCD7Q8N8D1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDCD7Q8N8D1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDCD7Q8N8D1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDCD7Q8N8D1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDCD7Q8N8D1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDCD7Q8N8D1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCD7Q8N8D1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCD7Q8N8D1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCD7Q8N8D1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCD7Q8N8D1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCD7Q8N8D1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCD7Q8N8D1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDCD7Q8N8D1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDCD7Q8N8D1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDCD7Q8N8D1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDCD7Q8N8D1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDCD7Q8N8D1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDCD7Q8N8D1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDCD7Q8N8D1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDCD7Q8N8D1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDCD7Q8N8D1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDCD7Q8N8D1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PDCD7Q8N8D1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDCD7Q8N8D1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDCD7Q8N8D1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDCD7Q8N8D1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDCD7Q8N8D1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDCD7Q8N8D1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms