Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G1

LINC00337, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00337, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00337Q8N6G1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00337Q8N6G1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00337Q8N6G1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00337Q8N6G1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00337Q8N6G1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00337Q8N6G1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00337Q8N6G1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00337Q8N6G1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00337Q8N6G1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00337Q8N6G1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00337Q8N6G1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00337Q8N6G1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00337Q8N6G1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00337Q8N6G1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00337Q8N6G1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00337Q8N6G1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00337Q8N6G1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00337Q8N6G1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00337Q8N6G1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00337Q8N6G1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00337Q8N6G1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00337Q8N6G1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00337Q8N6G1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00337Q8N6G1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00337Q8N6G1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00337Q8N6G1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00337Q8N6G1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00337Q8N6G1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00337Q8N6G1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00337Q8N6G1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00337Q8N6G1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00337Q8N6G1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00337Q8N6G1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00337Q8N6G1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00337Q8N6G1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00337Q8N6G1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00337Q8N6G1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00337Q8N6G1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00337Q8N6G1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00337Q8N6G1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00337Q8N6G1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00337Q8N6G1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00337Q8N6G1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00337Q8N6G1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00337Q8N6G1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00337Q8N6G1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00337Q8N6G1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00337Q8N6G1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00337Q8N6G1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00337Q8N6G1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00337Q8N6G1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00337Q8N6G1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00337Q8N6G1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00337Q8N6G1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00337Q8N6G1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00337Q8N6G1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00337Q8N6G1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00337Q8N6G1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00337Q8N6G1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00337Q8N6G1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00337Q8N6G1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00337Q8N6G1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00337Q8N6G1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00337Q8N6G1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00337Q8N6G1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00337Q8N6G1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00337Q8N6G1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00337Q8N6G1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00337Q8N6G1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00337Q8N6G1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00337Q8N6G1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00337Q8N6G1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00337Q8N6G1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00337Q8N6G1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00337Q8N6G1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00337Q8N6G1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00337Q8N6G1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00337Q8N6G1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00337Q8N6G1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00337Q8N6G1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00337Q8N6G1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00337Q8N6G1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00337Q8N6G1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00337Q8N6G1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00337Q8N6G1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00337Q8N6G1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00337Q8N6G1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00337Q8N6G1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00337Q8N6G1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00337Q8N6G1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00337Q8N6G1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00337Q8N6G1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00337Q8N6G1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00337Q8N6G1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00337Q8N6G1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00337Q8N6G1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00337Q8N6G1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00337Q8N6G1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00337Q8N6G1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00337Q8N6G1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms