Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMIM20Q8N5G0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM20Q8N5G0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SMIM20Q8N5G0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM20Q8N5G0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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