Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SVOPQ8N4V2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SVOPQ8N4V2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SVOPQ8N4V2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SVOPQ8N4V2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SVOPQ8N4V2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SVOPQ8N4V2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SVOPQ8N4V2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SVOPQ8N4V2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SVOPQ8N4V2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SVOPQ8N4V2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SVOPQ8N4V2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SVOPQ8N4V2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SVOPQ8N4V2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SVOPQ8N4V2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SVOPQ8N4V2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SVOPQ8N4V2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SVOPQ8N4V2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SVOPQ8N4V2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
SVOPQ8N4V2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SVOPQ8N4V2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SVOPQ8N4V2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SVOPQ8N4V2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SVOPQ8N4V2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SVOPQ8N4V2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SVOPQ8N4V2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SVOPQ8N4V2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SVOPQ8N4V2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SVOPQ8N4V2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SVOPQ8N4V2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SVOPQ8N4V2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SVOPQ8N4V2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SVOPQ8N4V2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SVOPQ8N4V2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SVOPQ8N4V2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SVOPQ8N4V2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SVOPQ8N4V2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SVOPQ8N4V2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SVOPQ8N4V2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SVOPQ8N4V2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SVOPQ8N4V2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SVOPQ8N4V2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SVOPQ8N4V2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SVOPQ8N4V2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SVOPQ8N4V2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SVOPQ8N4V2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SVOPQ8N4V2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SVOPQ8N4V2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SVOPQ8N4V2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SVOPQ8N4V2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SVOPQ8N4V2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SVOPQ8N4V2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SVOPQ8N4V2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SVOPQ8N4V2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SVOPQ8N4V2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SVOPQ8N4V2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SVOPQ8N4V2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SVOPQ8N4V2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SVOPQ8N4V2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SVOPQ8N4V2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SVOPQ8N4V2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SVOPQ8N4V2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SVOPQ8N4V2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SVOPQ8N4V2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SVOPQ8N4V2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SVOPQ8N4V2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SVOPQ8N4V2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SVOPQ8N4V2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SVOPQ8N4V2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SVOPQ8N4V2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SVOPQ8N4V2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SVOPQ8N4V2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SVOPQ8N4V2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SVOPQ8N4V2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SVOPQ8N4V2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SVOPQ8N4V2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SVOPQ8N4V2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SVOPQ8N4V2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SVOPQ8N4V2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SVOPQ8N4V2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SVOPQ8N4V2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SVOPQ8N4V2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SVOPQ8N4V2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SVOPQ8N4V2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SVOPQ8N4V2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SVOPQ8N4V2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SVOPQ8N4V2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SVOPQ8N4V2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SVOPQ8N4V2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SVOPQ8N4V2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SVOPQ8N4V2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SVOPQ8N4V2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SVOPQ8N4V2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SVOPQ8N4V2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SVOPQ8N4V2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SVOPQ8N4V2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SVOPQ8N4V2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SVOPQ8N4V2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SVOPQ8N4V2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SVOPQ8N4V2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms