Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4K4

RPRML, Reprimo-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMLQ8N4K4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPRMLQ8N4K4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPRMLQ8N4K4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPRMLQ8N4K4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPRMLQ8N4K4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPRMLQ8N4K4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPRMLQ8N4K4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPRMLQ8N4K4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPRMLQ8N4K4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPRMLQ8N4K4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPRMLQ8N4K4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPRMLQ8N4K4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPRMLQ8N4K4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPRMLQ8N4K4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPRMLQ8N4K4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPRMLQ8N4K4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPRMLQ8N4K4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPRMLQ8N4K4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPRMLQ8N4K4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPRMLQ8N4K4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPRMLQ8N4K4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPRMLQ8N4K4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPRMLQ8N4K4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPRMLQ8N4K4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPRMLQ8N4K4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPRMLQ8N4K4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPRMLQ8N4K4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPRMLQ8N4K4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPRMLQ8N4K4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPRMLQ8N4K4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPRMLQ8N4K4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPRMLQ8N4K4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPRMLQ8N4K4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPRMLQ8N4K4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPRMLQ8N4K4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPRMLQ8N4K4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPRMLQ8N4K4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPRMLQ8N4K4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPRMLQ8N4K4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPRMLQ8N4K4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPRMLQ8N4K4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPRMLQ8N4K4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPRMLQ8N4K4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPRMLQ8N4K4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPRMLQ8N4K4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPRMLQ8N4K4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPRMLQ8N4K4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPRMLQ8N4K4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPRMLQ8N4K4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPRMLQ8N4K4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPRMLQ8N4K4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RPRMLQ8N4K4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RPRMLQ8N4K4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RPRMLQ8N4K4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RPRMLQ8N4K4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RPRMLQ8N4K4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RPRMLQ8N4K4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RPRMLQ8N4K4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RPRMLQ8N4K4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RPRMLQ8N4K4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPRMLQ8N4K4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPRMLQ8N4K4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPRMLQ8N4K4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPRMLQ8N4K4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPRMLQ8N4K4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPRMLQ8N4K4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPRMLQ8N4K4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPRMLQ8N4K4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPRMLQ8N4K4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPRMLQ8N4K4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPRMLQ8N4K4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPRMLQ8N4K4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPRMLQ8N4K4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RPRMLQ8N4K4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPRMLQ8N4K4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPRMLQ8N4K4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPRMLQ8N4K4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPRMLQ8N4K4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPRMLQ8N4K4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPRMLQ8N4K4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPRMLQ8N4K4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RPRMLQ8N4K4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPRMLQ8N4K4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPRMLQ8N4K4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPRMLQ8N4K4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPRMLQ8N4K4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPRMLQ8N4K4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPRMLQ8N4K4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPRMLQ8N4K4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPRMLQ8N4K4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPRMLQ8N4K4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPRMLQ8N4K4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPRMLQ8N4K4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RPRMLQ8N4K4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPRMLQ8N4K4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPRMLQ8N4K4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPRMLQ8N4K4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPRMLQ8N4K4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPRMLQ8N4K4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPRMLQ8N4K4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms