Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDCL2Q8N4E4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDCL2Q8N4E4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDCL2Q8N4E4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDCL2Q8N4E4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDCL2Q8N4E4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PDCL2Q8N4E4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDCL2Q8N4E4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDCL2Q8N4E4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDCL2Q8N4E4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDCL2Q8N4E4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDCL2Q8N4E4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDCL2Q8N4E4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDCL2Q8N4E4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDCL2Q8N4E4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDCL2Q8N4E4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDCL2Q8N4E4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDCL2Q8N4E4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDCL2Q8N4E4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDCL2Q8N4E4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDCL2Q8N4E4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDCL2Q8N4E4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDCL2Q8N4E4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PDCL2Q8N4E4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDCL2Q8N4E4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDCL2Q8N4E4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDCL2Q8N4E4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDCL2Q8N4E4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDCL2Q8N4E4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDCL2Q8N4E4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDCL2Q8N4E4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDCL2Q8N4E4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDCL2Q8N4E4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDCL2Q8N4E4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PDCL2Q8N4E4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDCL2Q8N4E4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDCL2Q8N4E4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDCL2Q8N4E4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDCL2Q8N4E4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDCL2Q8N4E4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDCL2Q8N4E4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDCL2Q8N4E4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PDCL2Q8N4E4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDCL2Q8N4E4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PDCL2Q8N4E4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDCL2Q8N4E4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PDCL2Q8N4E4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDCL2Q8N4E4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDCL2Q8N4E4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDCL2Q8N4E4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PDCL2Q8N4E4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDCL2Q8N4E4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDCL2Q8N4E4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PDCL2Q8N4E4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDCL2Q8N4E4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDCL2Q8N4E4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDCL2Q8N4E4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDCL2Q8N4E4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDCL2Q8N4E4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDCL2Q8N4E4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDCL2Q8N4E4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDCL2Q8N4E4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDCL2Q8N4E4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDCL2Q8N4E4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDCL2Q8N4E4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDCL2Q8N4E4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDCL2Q8N4E4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PDCL2Q8N4E4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDCL2Q8N4E4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDCL2Q8N4E4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDCL2Q8N4E4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDCL2Q8N4E4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDCL2Q8N4E4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDCL2Q8N4E4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDCL2Q8N4E4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDCL2Q8N4E4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDCL2Q8N4E4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDCL2Q8N4E4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDCL2Q8N4E4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDCL2Q8N4E4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PDCL2Q8N4E4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDCL2Q8N4E4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDCL2Q8N4E4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PDCL2Q8N4E4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDCL2Q8N4E4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDCL2Q8N4E4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PDCL2Q8N4E4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDCL2Q8N4E4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDCL2Q8N4E4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDCL2Q8N4E4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDCL2Q8N4E4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDCL2Q8N4E4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDCL2Q8N4E4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDCL2Q8N4E4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDCL2Q8N4E4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDCL2Q8N4E4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDCL2Q8N4E4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDCL2Q8N4E4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDCL2Q8N4E4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDCL2Q8N4E4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms