Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RYBPQ8N488 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RYBPQ8N488 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RYBPQ8N488 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RYBPQ8N488 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RYBPQ8N488 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RYBPQ8N488 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RYBPQ8N488 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RYBPQ8N488 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RYBPQ8N488 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RYBPQ8N488 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RYBPQ8N488 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RYBPQ8N488 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RYBPQ8N488 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RYBPQ8N488 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RYBPQ8N488 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RYBPQ8N488 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RYBPQ8N488 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RYBPQ8N488 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RYBPQ8N488 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RYBPQ8N488 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RYBPQ8N488 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RYBPQ8N488 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RYBPQ8N488 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RYBPQ8N488 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RYBPQ8N488 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RYBPQ8N488 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RYBPQ8N488 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RYBPQ8N488 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RYBPQ8N488 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RYBPQ8N488 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RYBPQ8N488 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RYBPQ8N488 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RYBPQ8N488 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RYBPQ8N488 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RYBPQ8N488 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RYBPQ8N488 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RYBPQ8N488 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RYBPQ8N488 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RYBPQ8N488 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RYBPQ8N488 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RYBPQ8N488 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RYBPQ8N488 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RYBPQ8N488 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RYBPQ8N488 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RYBPQ8N488 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RYBPQ8N488 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RYBPQ8N488 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RYBPQ8N488 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RYBPQ8N488 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RYBPQ8N488 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RYBPQ8N488 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RYBPQ8N488 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RYBPQ8N488 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RYBPQ8N488 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RYBPQ8N488 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RYBPQ8N488 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RYBPQ8N488 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RYBPQ8N488 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RYBPQ8N488 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RYBPQ8N488 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RYBPQ8N488 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RYBPQ8N488 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RYBPQ8N488 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RYBPQ8N488 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RYBPQ8N488 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RYBPQ8N488 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RYBPQ8N488 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RYBPQ8N488 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RYBPQ8N488 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RYBPQ8N488 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RYBPQ8N488 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RYBPQ8N488 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RYBPQ8N488 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RYBPQ8N488 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RYBPQ8N488 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RYBPQ8N488 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RYBPQ8N488 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RYBPQ8N488 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RYBPQ8N488 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RYBPQ8N488 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RYBPQ8N488 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RYBPQ8N488 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RYBPQ8N488 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RYBPQ8N488 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RYBPQ8N488 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RYBPQ8N488 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RYBPQ8N488 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RYBPQ8N488 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RYBPQ8N488 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RYBPQ8N488 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RYBPQ8N488 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RYBPQ8N488 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RYBPQ8N488 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RYBPQ8N488 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RYBPQ8N488 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RYBPQ8N488 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RYBPQ8N488 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RYBPQ8N488 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RYBPQ8N488 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms