Protein–RNA interactions for Protein: Q8N434

SVOPL, Putative transporter SVOPL, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPLQ8N434 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SVOPLQ8N434 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SVOPLQ8N434 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SVOPLQ8N434 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SVOPLQ8N434 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SVOPLQ8N434 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SVOPLQ8N434 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SVOPLQ8N434 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SVOPLQ8N434 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SVOPLQ8N434 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SVOPLQ8N434 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SVOPLQ8N434 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SVOPLQ8N434 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SVOPLQ8N434 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SVOPLQ8N434 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SVOPLQ8N434 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SVOPLQ8N434 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SVOPLQ8N434 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SVOPLQ8N434 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SVOPLQ8N434 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SVOPLQ8N434 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SVOPLQ8N434 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SVOPLQ8N434 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SVOPLQ8N434 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SVOPLQ8N434 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SVOPLQ8N434 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SVOPLQ8N434 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SVOPLQ8N434 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SVOPLQ8N434 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SVOPLQ8N434 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SVOPLQ8N434 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SVOPLQ8N434 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SVOPLQ8N434 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SVOPLQ8N434 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SVOPLQ8N434 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SVOPLQ8N434 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SVOPLQ8N434 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SVOPLQ8N434 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SVOPLQ8N434 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SVOPLQ8N434 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SVOPLQ8N434 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SVOPLQ8N434 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SVOPLQ8N434 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SVOPLQ8N434 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SVOPLQ8N434 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SVOPLQ8N434 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SVOPLQ8N434 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SVOPLQ8N434 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SVOPLQ8N434 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SVOPLQ8N434 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SVOPLQ8N434 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SVOPLQ8N434 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SVOPLQ8N434 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SVOPLQ8N434 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SVOPLQ8N434 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SVOPLQ8N434 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SVOPLQ8N434 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SVOPLQ8N434 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SVOPLQ8N434 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SVOPLQ8N434 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SVOPLQ8N434 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SVOPLQ8N434 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SVOPLQ8N434 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SVOPLQ8N434 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SVOPLQ8N434 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SVOPLQ8N434 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SVOPLQ8N434 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SVOPLQ8N434 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SVOPLQ8N434 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SVOPLQ8N434 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SVOPLQ8N434 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SVOPLQ8N434 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SVOPLQ8N434 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SVOPLQ8N434 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SVOPLQ8N434 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SVOPLQ8N434 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SVOPLQ8N434 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SVOPLQ8N434 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SVOPLQ8N434 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SVOPLQ8N434 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SVOPLQ8N434 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SVOPLQ8N434 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SVOPLQ8N434 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SVOPLQ8N434 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SVOPLQ8N434 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SVOPLQ8N434 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SVOPLQ8N434 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SVOPLQ8N434 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SVOPLQ8N434 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SVOPLQ8N434 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SVOPLQ8N434 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SVOPLQ8N434 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SVOPLQ8N434 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SVOPLQ8N434 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SVOPLQ8N434 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SVOPLQ8N434 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SVOPLQ8N434 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SVOPLQ8N434 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SVOPLQ8N434 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SVOPLQ8N434 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms