Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0W4

NLGN4X, Neuroligin-4, X-linked, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4XQ8N0W4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLGN4XQ8N0W4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NLGN4XQ8N0W4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLGN4XQ8N0W4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLGN4XQ8N0W4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLGN4XQ8N0W4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLGN4XQ8N0W4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLGN4XQ8N0W4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLGN4XQ8N0W4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLGN4XQ8N0W4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLGN4XQ8N0W4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLGN4XQ8N0W4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLGN4XQ8N0W4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLGN4XQ8N0W4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLGN4XQ8N0W4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLGN4XQ8N0W4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLGN4XQ8N0W4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLGN4XQ8N0W4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLGN4XQ8N0W4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLGN4XQ8N0W4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLGN4XQ8N0W4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLGN4XQ8N0W4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLGN4XQ8N0W4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLGN4XQ8N0W4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLGN4XQ8N0W4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLGN4XQ8N0W4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NLGN4XQ8N0W4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLGN4XQ8N0W4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLGN4XQ8N0W4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NLGN4XQ8N0W4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLGN4XQ8N0W4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLGN4XQ8N0W4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLGN4XQ8N0W4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLGN4XQ8N0W4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NLGN4XQ8N0W4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLGN4XQ8N0W4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLGN4XQ8N0W4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLGN4XQ8N0W4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLGN4XQ8N0W4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLGN4XQ8N0W4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLGN4XQ8N0W4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NLGN4XQ8N0W4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLGN4XQ8N0W4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLGN4XQ8N0W4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLGN4XQ8N0W4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLGN4XQ8N0W4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLGN4XQ8N0W4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLGN4XQ8N0W4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLGN4XQ8N0W4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLGN4XQ8N0W4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NLGN4XQ8N0W4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NLGN4XQ8N0W4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NLGN4XQ8N0W4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLGN4XQ8N0W4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLGN4XQ8N0W4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NLGN4XQ8N0W4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLGN4XQ8N0W4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLGN4XQ8N0W4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLGN4XQ8N0W4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NLGN4XQ8N0W4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NLGN4XQ8N0W4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NLGN4XQ8N0W4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NLGN4XQ8N0W4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NLGN4XQ8N0W4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NLGN4XQ8N0W4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLGN4XQ8N0W4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLGN4XQ8N0W4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLGN4XQ8N0W4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLGN4XQ8N0W4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLGN4XQ8N0W4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLGN4XQ8N0W4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLGN4XQ8N0W4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLGN4XQ8N0W4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLGN4XQ8N0W4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLGN4XQ8N0W4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLGN4XQ8N0W4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLGN4XQ8N0W4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NLGN4XQ8N0W4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLGN4XQ8N0W4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLGN4XQ8N0W4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLGN4XQ8N0W4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NLGN4XQ8N0W4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLGN4XQ8N0W4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLGN4XQ8N0W4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLGN4XQ8N0W4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLGN4XQ8N0W4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLGN4XQ8N0W4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLGN4XQ8N0W4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLGN4XQ8N0W4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLGN4XQ8N0W4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLGN4XQ8N0W4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLGN4XQ8N0W4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLGN4XQ8N0W4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLGN4XQ8N0W4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLGN4XQ8N0W4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLGN4XQ8N0W4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLGN4XQ8N0W4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLGN4XQ8N0W4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLGN4XQ8N0W4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLGN4XQ8N0W4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms