Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZQ1

WDFY3, WD repeat and FYVE domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDFY3Q8IZQ1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
WDFY3Q8IZQ1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
WDFY3Q8IZQ1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
WDFY3Q8IZQ1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
WDFY3Q8IZQ1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
WDFY3Q8IZQ1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WDFY3Q8IZQ1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
WDFY3Q8IZQ1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
WDFY3Q8IZQ1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WDFY3Q8IZQ1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WDFY3Q8IZQ1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WDFY3Q8IZQ1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
WDFY3Q8IZQ1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WDFY3Q8IZQ1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WDFY3Q8IZQ1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDFY3Q8IZQ1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDFY3Q8IZQ1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDFY3Q8IZQ1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDFY3Q8IZQ1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDFY3Q8IZQ1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WDFY3Q8IZQ1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDFY3Q8IZQ1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDFY3Q8IZQ1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDFY3Q8IZQ1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDFY3Q8IZQ1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDFY3Q8IZQ1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDFY3Q8IZQ1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDFY3Q8IZQ1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDFY3Q8IZQ1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDFY3Q8IZQ1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDFY3Q8IZQ1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
WDFY3Q8IZQ1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDFY3Q8IZQ1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
WDFY3Q8IZQ1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDFY3Q8IZQ1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDFY3Q8IZQ1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WDFY3Q8IZQ1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WDFY3Q8IZQ1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDFY3Q8IZQ1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDFY3Q8IZQ1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDFY3Q8IZQ1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDFY3Q8IZQ1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDFY3Q8IZQ1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDFY3Q8IZQ1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDFY3Q8IZQ1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDFY3Q8IZQ1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDFY3Q8IZQ1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDFY3Q8IZQ1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WDFY3Q8IZQ1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDFY3Q8IZQ1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
WDFY3Q8IZQ1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
WDFY3Q8IZQ1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
WDFY3Q8IZQ1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
WDFY3Q8IZQ1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
WDFY3Q8IZQ1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
WDFY3Q8IZQ1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
WDFY3Q8IZQ1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
WDFY3Q8IZQ1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WDFY3Q8IZQ1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
WDFY3Q8IZQ1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WDFY3Q8IZQ1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDFY3Q8IZQ1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDFY3Q8IZQ1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDFY3Q8IZQ1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDFY3Q8IZQ1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDFY3Q8IZQ1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDFY3Q8IZQ1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDFY3Q8IZQ1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDFY3Q8IZQ1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDFY3Q8IZQ1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDFY3Q8IZQ1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WDFY3Q8IZQ1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
WDFY3Q8IZQ1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
WDFY3Q8IZQ1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WDFY3Q8IZQ1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
WDFY3Q8IZQ1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
WDFY3Q8IZQ1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
WDFY3Q8IZQ1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDFY3Q8IZQ1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
WDFY3Q8IZQ1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDFY3Q8IZQ1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDFY3Q8IZQ1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
WDFY3Q8IZQ1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDFY3Q8IZQ1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDFY3Q8IZQ1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDFY3Q8IZQ1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
WDFY3Q8IZQ1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
WDFY3Q8IZQ1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
WDFY3Q8IZQ1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
WDFY3Q8IZQ1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
WDFY3Q8IZQ1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
WDFY3Q8IZQ1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDFY3Q8IZQ1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDFY3Q8IZQ1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDFY3Q8IZQ1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WDFY3Q8IZQ1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDFY3Q8IZQ1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDFY3Q8IZQ1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDFY3Q8IZQ1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WDFY3Q8IZQ1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms