Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMNTD2Q8IXW0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMNTD2Q8IXW0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMNTD2Q8IXW0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
LMNTD2Q8IXW0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMNTD2Q8IXW0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMNTD2Q8IXW0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMNTD2Q8IXW0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMNTD2Q8IXW0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMNTD2Q8IXW0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMNTD2Q8IXW0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMNTD2Q8IXW0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMNTD2Q8IXW0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMNTD2Q8IXW0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMNTD2Q8IXW0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMNTD2Q8IXW0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMNTD2Q8IXW0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMNTD2Q8IXW0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMNTD2Q8IXW0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMNTD2Q8IXW0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LMNTD2Q8IXW0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LMNTD2Q8IXW0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMNTD2Q8IXW0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMNTD2Q8IXW0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMNTD2Q8IXW0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LMNTD2Q8IXW0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMNTD2Q8IXW0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMNTD2Q8IXW0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LMNTD2Q8IXW0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMNTD2Q8IXW0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMNTD2Q8IXW0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMNTD2Q8IXW0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMNTD2Q8IXW0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMNTD2Q8IXW0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMNTD2Q8IXW0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMNTD2Q8IXW0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMNTD2Q8IXW0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMNTD2Q8IXW0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LMNTD2Q8IXW0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMNTD2Q8IXW0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMNTD2Q8IXW0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMNTD2Q8IXW0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMNTD2Q8IXW0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMNTD2Q8IXW0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMNTD2Q8IXW0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMNTD2Q8IXW0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMNTD2Q8IXW0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMNTD2Q8IXW0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMNTD2Q8IXW0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMNTD2Q8IXW0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMNTD2Q8IXW0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMNTD2Q8IXW0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMNTD2Q8IXW0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMNTD2Q8IXW0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMNTD2Q8IXW0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMNTD2Q8IXW0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMNTD2Q8IXW0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMNTD2Q8IXW0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LMNTD2Q8IXW0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LMNTD2Q8IXW0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LMNTD2Q8IXW0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LMNTD2Q8IXW0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMNTD2Q8IXW0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMNTD2Q8IXW0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMNTD2Q8IXW0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMNTD2Q8IXW0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMNTD2Q8IXW0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMNTD2Q8IXW0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMNTD2Q8IXW0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMNTD2Q8IXW0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMNTD2Q8IXW0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMNTD2Q8IXW0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMNTD2Q8IXW0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMNTD2Q8IXW0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMNTD2Q8IXW0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMNTD2Q8IXW0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LMNTD2Q8IXW0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMNTD2Q8IXW0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMNTD2Q8IXW0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMNTD2Q8IXW0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMNTD2Q8IXW0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMNTD2Q8IXW0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMNTD2Q8IXW0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMNTD2Q8IXW0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMNTD2Q8IXW0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMNTD2Q8IXW0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMNTD2Q8IXW0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMNTD2Q8IXW0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMNTD2Q8IXW0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMNTD2Q8IXW0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMNTD2Q8IXW0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMNTD2Q8IXW0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMNTD2Q8IXW0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMNTD2Q8IXW0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMNTD2Q8IXW0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMNTD2Q8IXW0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMNTD2Q8IXW0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMNTD2Q8IXW0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms