Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXN7

RIMKLA, N-acetylaspartylglutamate synthase A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLAQ8IXN7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIMKLAQ8IXN7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RIMKLAQ8IXN7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIMKLAQ8IXN7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIMKLAQ8IXN7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIMKLAQ8IXN7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIMKLAQ8IXN7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIMKLAQ8IXN7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIMKLAQ8IXN7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIMKLAQ8IXN7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIMKLAQ8IXN7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIMKLAQ8IXN7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIMKLAQ8IXN7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIMKLAQ8IXN7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RIMKLAQ8IXN7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIMKLAQ8IXN7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIMKLAQ8IXN7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIMKLAQ8IXN7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIMKLAQ8IXN7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIMKLAQ8IXN7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RIMKLAQ8IXN7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RIMKLAQ8IXN7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RIMKLAQ8IXN7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIMKLAQ8IXN7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIMKLAQ8IXN7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIMKLAQ8IXN7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIMKLAQ8IXN7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIMKLAQ8IXN7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIMKLAQ8IXN7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIMKLAQ8IXN7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIMKLAQ8IXN7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIMKLAQ8IXN7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIMKLAQ8IXN7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIMKLAQ8IXN7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIMKLAQ8IXN7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIMKLAQ8IXN7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
RIMKLAQ8IXN7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RIMKLAQ8IXN7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RIMKLAQ8IXN7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIMKLAQ8IXN7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIMKLAQ8IXN7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIMKLAQ8IXN7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIMKLAQ8IXN7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIMKLAQ8IXN7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIMKLAQ8IXN7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIMKLAQ8IXN7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIMKLAQ8IXN7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIMKLAQ8IXN7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIMKLAQ8IXN7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIMKLAQ8IXN7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIMKLAQ8IXN7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIMKLAQ8IXN7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIMKLAQ8IXN7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIMKLAQ8IXN7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIMKLAQ8IXN7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RIMKLAQ8IXN7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RIMKLAQ8IXN7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIMKLAQ8IXN7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIMKLAQ8IXN7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RIMKLAQ8IXN7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIMKLAQ8IXN7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIMKLAQ8IXN7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIMKLAQ8IXN7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RIMKLAQ8IXN7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIMKLAQ8IXN7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIMKLAQ8IXN7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIMKLAQ8IXN7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIMKLAQ8IXN7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RIMKLAQ8IXN7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIMKLAQ8IXN7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIMKLAQ8IXN7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIMKLAQ8IXN7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIMKLAQ8IXN7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIMKLAQ8IXN7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIMKLAQ8IXN7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIMKLAQ8IXN7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIMKLAQ8IXN7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIMKLAQ8IXN7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIMKLAQ8IXN7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIMKLAQ8IXN7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIMKLAQ8IXN7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIMKLAQ8IXN7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIMKLAQ8IXN7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RIMKLAQ8IXN7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIMKLAQ8IXN7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIMKLAQ8IXN7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIMKLAQ8IXN7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIMKLAQ8IXN7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIMKLAQ8IXN7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIMKLAQ8IXN7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIMKLAQ8IXN7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIMKLAQ8IXN7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIMKLAQ8IXN7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RIMKLAQ8IXN7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIMKLAQ8IXN7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIMKLAQ8IXN7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIMKLAQ8IXN7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIMKLAQ8IXN7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIMKLAQ8IXN7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIMKLAQ8IXN7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms