Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWA5

SLC44A2, Choline transporter-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A2Q8IWA5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC44A2Q8IWA5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC44A2Q8IWA5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC44A2Q8IWA5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC44A2Q8IWA5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC44A2Q8IWA5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC44A2Q8IWA5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC44A2Q8IWA5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC44A2Q8IWA5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC44A2Q8IWA5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC44A2Q8IWA5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC44A2Q8IWA5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC44A2Q8IWA5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC44A2Q8IWA5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC44A2Q8IWA5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC44A2Q8IWA5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC44A2Q8IWA5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC44A2Q8IWA5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC44A2Q8IWA5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC44A2Q8IWA5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC44A2Q8IWA5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC44A2Q8IWA5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC44A2Q8IWA5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC44A2Q8IWA5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC44A2Q8IWA5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC44A2Q8IWA5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC44A2Q8IWA5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC44A2Q8IWA5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC44A2Q8IWA5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC44A2Q8IWA5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC44A2Q8IWA5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC44A2Q8IWA5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC44A2Q8IWA5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC44A2Q8IWA5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC44A2Q8IWA5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC44A2Q8IWA5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC44A2Q8IWA5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC44A2Q8IWA5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC44A2Q8IWA5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC44A2Q8IWA5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC44A2Q8IWA5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC44A2Q8IWA5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC44A2Q8IWA5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC44A2Q8IWA5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC44A2Q8IWA5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC44A2Q8IWA5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC44A2Q8IWA5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC44A2Q8IWA5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC44A2Q8IWA5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC44A2Q8IWA5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC44A2Q8IWA5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC44A2Q8IWA5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC44A2Q8IWA5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC44A2Q8IWA5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC44A2Q8IWA5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC44A2Q8IWA5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC44A2Q8IWA5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC44A2Q8IWA5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC44A2Q8IWA5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC44A2Q8IWA5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC44A2Q8IWA5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC44A2Q8IWA5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC44A2Q8IWA5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC44A2Q8IWA5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC44A2Q8IWA5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC44A2Q8IWA5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC44A2Q8IWA5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC44A2Q8IWA5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC44A2Q8IWA5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC44A2Q8IWA5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC44A2Q8IWA5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC44A2Q8IWA5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC44A2Q8IWA5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC44A2Q8IWA5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC44A2Q8IWA5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC44A2Q8IWA5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC44A2Q8IWA5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC44A2Q8IWA5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC44A2Q8IWA5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC44A2Q8IWA5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC44A2Q8IWA5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC44A2Q8IWA5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC44A2Q8IWA5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC44A2Q8IWA5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC44A2Q8IWA5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC44A2Q8IWA5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC44A2Q8IWA5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC44A2Q8IWA5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC44A2Q8IWA5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC44A2Q8IWA5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC44A2Q8IWA5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC44A2Q8IWA5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC44A2Q8IWA5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC44A2Q8IWA5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC44A2Q8IWA5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC44A2Q8IWA5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC44A2Q8IWA5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC44A2Q8IWA5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC44A2Q8IWA5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC44A2Q8IWA5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms