Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNGA4Q8IV77 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNGA4Q8IV77 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNGA4Q8IV77 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNGA4Q8IV77 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNGA4Q8IV77 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNGA4Q8IV77 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNGA4Q8IV77 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNGA4Q8IV77 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CNGA4Q8IV77 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNGA4Q8IV77 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNGA4Q8IV77 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNGA4Q8IV77 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNGA4Q8IV77 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNGA4Q8IV77 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNGA4Q8IV77 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNGA4Q8IV77 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNGA4Q8IV77 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNGA4Q8IV77 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNGA4Q8IV77 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNGA4Q8IV77 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNGA4Q8IV77 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNGA4Q8IV77 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNGA4Q8IV77 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CNGA4Q8IV77 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CNGA4Q8IV77 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNGA4Q8IV77 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNGA4Q8IV77 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNGA4Q8IV77 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNGA4Q8IV77 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNGA4Q8IV77 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNGA4Q8IV77 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNGA4Q8IV77 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNGA4Q8IV77 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNGA4Q8IV77 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNGA4Q8IV77 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNGA4Q8IV77 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CNGA4Q8IV77 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNGA4Q8IV77 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CNGA4Q8IV77 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNGA4Q8IV77 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNGA4Q8IV77 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNGA4Q8IV77 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNGA4Q8IV77 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNGA4Q8IV77 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNGA4Q8IV77 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNGA4Q8IV77 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNGA4Q8IV77 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNGA4Q8IV77 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNGA4Q8IV77 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNGA4Q8IV77 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CNGA4Q8IV77 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNGA4Q8IV77 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNGA4Q8IV77 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNGA4Q8IV77 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNGA4Q8IV77 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNGA4Q8IV77 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNGA4Q8IV77 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNGA4Q8IV77 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNGA4Q8IV77 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNGA4Q8IV77 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNGA4Q8IV77 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNGA4Q8IV77 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNGA4Q8IV77 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNGA4Q8IV77 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CNGA4Q8IV77 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNGA4Q8IV77 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNGA4Q8IV77 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNGA4Q8IV77 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNGA4Q8IV77 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNGA4Q8IV77 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNGA4Q8IV77 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNGA4Q8IV77 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNGA4Q8IV77 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNGA4Q8IV77 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNGA4Q8IV77 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNGA4Q8IV77 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNGA4Q8IV77 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNGA4Q8IV77 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNGA4Q8IV77 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNGA4Q8IV77 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNGA4Q8IV77 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNGA4Q8IV77 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CNGA4Q8IV77 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CNGA4Q8IV77 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNGA4Q8IV77 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNGA4Q8IV77 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNGA4Q8IV77 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNGA4Q8IV77 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNGA4Q8IV77 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNGA4Q8IV77 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNGA4Q8IV77 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNGA4Q8IV77 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNGA4Q8IV77 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNGA4Q8IV77 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNGA4Q8IV77 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNGA4Q8IV77 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNGA4Q8IV77 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNGA4Q8IV77 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNGA4Q8IV77 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms