Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUR0

TRAPPC5, Trafficking protein particle complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC5Q8IUR0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC5Q8IUR0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC5Q8IUR0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC5Q8IUR0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC5Q8IUR0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC5Q8IUR0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC5Q8IUR0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC5Q8IUR0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC5Q8IUR0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC5Q8IUR0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC5Q8IUR0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC5Q8IUR0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC5Q8IUR0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC5Q8IUR0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC5Q8IUR0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC5Q8IUR0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC5Q8IUR0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC5Q8IUR0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC5Q8IUR0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC5Q8IUR0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC5Q8IUR0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC5Q8IUR0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC5Q8IUR0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC5Q8IUR0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC5Q8IUR0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC5Q8IUR0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC5Q8IUR0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC5Q8IUR0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRAPPC5Q8IUR0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRAPPC5Q8IUR0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC5Q8IUR0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC5Q8IUR0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC5Q8IUR0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC5Q8IUR0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC5Q8IUR0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC5Q8IUR0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC5Q8IUR0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC5Q8IUR0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC5Q8IUR0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC5Q8IUR0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC5Q8IUR0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC5Q8IUR0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC5Q8IUR0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC5Q8IUR0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC5Q8IUR0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC5Q8IUR0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC5Q8IUR0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC5Q8IUR0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC5Q8IUR0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC5Q8IUR0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC5Q8IUR0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC5Q8IUR0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC5Q8IUR0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC5Q8IUR0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC5Q8IUR0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC5Q8IUR0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC5Q8IUR0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC5Q8IUR0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC5Q8IUR0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC5Q8IUR0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC5Q8IUR0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC5Q8IUR0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC5Q8IUR0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC5Q8IUR0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC5Q8IUR0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC5Q8IUR0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC5Q8IUR0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC5Q8IUR0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC5Q8IUR0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC5Q8IUR0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC5Q8IUR0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC5Q8IUR0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC5Q8IUR0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC5Q8IUR0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC5Q8IUR0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC5Q8IUR0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC5Q8IUR0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC5Q8IUR0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC5Q8IUR0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC5Q8IUR0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC5Q8IUR0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC5Q8IUR0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC5Q8IUR0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC5Q8IUR0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC5Q8IUR0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC5Q8IUR0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC5Q8IUR0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC5Q8IUR0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC5Q8IUR0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC5Q8IUR0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC5Q8IUR0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC5Q8IUR0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC5Q8IUR0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC5Q8IUR0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC5Q8IUR0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC5Q8IUR0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC5Q8IUR0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC5Q8IUR0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC5Q8IUR0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC5Q8IUR0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms