Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TREML1Q86YW5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TREML1Q86YW5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TREML1Q86YW5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TREML1Q86YW5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TREML1Q86YW5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TREML1Q86YW5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TREML1Q86YW5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TREML1Q86YW5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TREML1Q86YW5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TREML1Q86YW5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TREML1Q86YW5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TREML1Q86YW5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TREML1Q86YW5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TREML1Q86YW5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TREML1Q86YW5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TREML1Q86YW5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TREML1Q86YW5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TREML1Q86YW5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TREML1Q86YW5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TREML1Q86YW5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TREML1Q86YW5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TREML1Q86YW5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TREML1Q86YW5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TREML1Q86YW5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TREML1Q86YW5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TREML1Q86YW5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TREML1Q86YW5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TREML1Q86YW5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TREML1Q86YW5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TREML1Q86YW5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TREML1Q86YW5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TREML1Q86YW5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TREML1Q86YW5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TREML1Q86YW5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TREML1Q86YW5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TREML1Q86YW5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TREML1Q86YW5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TREML1Q86YW5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TREML1Q86YW5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TREML1Q86YW5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TREML1Q86YW5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TREML1Q86YW5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TREML1Q86YW5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TREML1Q86YW5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TREML1Q86YW5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TREML1Q86YW5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TREML1Q86YW5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TREML1Q86YW5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TREML1Q86YW5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TREML1Q86YW5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TREML1Q86YW5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TREML1Q86YW5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TREML1Q86YW5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TREML1Q86YW5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TREML1Q86YW5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TREML1Q86YW5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TREML1Q86YW5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TREML1Q86YW5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TREML1Q86YW5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TREML1Q86YW5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TREML1Q86YW5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TREML1Q86YW5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TREML1Q86YW5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TREML1Q86YW5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TREML1Q86YW5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TREML1Q86YW5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TREML1Q86YW5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TREML1Q86YW5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TREML1Q86YW5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TREML1Q86YW5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TREML1Q86YW5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TREML1Q86YW5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TREML1Q86YW5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TREML1Q86YW5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TREML1Q86YW5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TREML1Q86YW5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TREML1Q86YW5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TREML1Q86YW5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TREML1Q86YW5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TREML1Q86YW5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TREML1Q86YW5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TREML1Q86YW5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TREML1Q86YW5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TREML1Q86YW5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TREML1Q86YW5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TREML1Q86YW5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TREML1Q86YW5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TREML1Q86YW5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TREML1Q86YW5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TREML1Q86YW5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TREML1Q86YW5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TREML1Q86YW5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TREML1Q86YW5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TREML1Q86YW5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TREML1Q86YW5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TREML1Q86YW5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TREML1Q86YW5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TREML1Q86YW5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TREML1Q86YW5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms