Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
NLRP13Q86W25 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NLRP13Q86W25 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
NLRP13Q86W25 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
NLRP13Q86W25 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
NLRP13Q86W25 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
NLRP13Q86W25 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
NLRP13Q86W25 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NLRP13Q86W25 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
NLRP13Q86W25 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NLRP13Q86W25 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NLRP13Q86W25 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.6■■■■□ 3.45
NLRP13Q86W25 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NLRP13Q86W25 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
NLRP13Q86W25 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.45
NLRP13Q86W25 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
NLRP13Q86W25 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
NLRP13Q86W25 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
NLRP13Q86W25 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
NLRP13Q86W25 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NLRP13Q86W25 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NLRP13Q86W25 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
NLRP13Q86W25 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
NLRP13Q86W25 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
NLRP13Q86W25 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
NLRP13Q86W25 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
NLRP13Q86W25 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
NLRP13Q86W25 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
NLRP13Q86W25 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
NLRP13Q86W25 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
NLRP13Q86W25 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
NLRP13Q86W25 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
NLRP13Q86W25 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
NLRP13Q86W25 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
NLRP13Q86W25 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC36.49■■■■□ 3.43
NLRP13Q86W25 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.49■■■■□ 3.43
NLRP13Q86W25 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NLRP13Q86W25 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NLRP13Q86W25 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NLRP13Q86W25 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
NLRP13Q86W25 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
NLRP13Q86W25 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
NLRP13Q86W25 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
NLRP13Q86W25 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NLRP13Q86W25 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NLRP13Q86W25 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NLRP13Q86W25 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NLRP13Q86W25 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NLRP13Q86W25 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NLRP13Q86W25 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NLRP13Q86W25 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NLRP13Q86W25 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NLRP13Q86W25 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
NLRP13Q86W25 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NLRP13Q86W25 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NLRP13Q86W25 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
NLRP13Q86W25 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NLRP13Q86W25 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
NLRP13Q86W25 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NLRP13Q86W25 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
NLRP13Q86W25 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NLRP13Q86W25 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NLRP13Q86W25 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
NLRP13Q86W25 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NLRP13Q86W25 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
NLRP13Q86W25 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
NLRP13Q86W25 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
NLRP13Q86W25 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NLRP13Q86W25 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NLRP13Q86W25 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
NLRP13Q86W25 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
NLRP13Q86W25 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
NLRP13Q86W25 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NLRP13Q86W25 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NLRP13Q86W25 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
NLRP13Q86W25 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
NLRP13Q86W25 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NLRP13Q86W25 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
NLRP13Q86W25 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
NLRP13Q86W25 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NLRP13Q86W25 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC36.29■■■■□ 3.4
NLRP13Q86W25 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NLRP13Q86W25 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NLRP13Q86W25 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NLRP13Q86W25 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NLRP13Q86W25 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NLRP13Q86W25 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NLRP13Q86W25 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NLRP13Q86W25 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
NLRP13Q86W25 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
NLRP13Q86W25 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NLRP13Q86W25 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NLRP13Q86W25 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NLRP13Q86W25 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NLRP13Q86W25 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NLRP13Q86W25 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NLRP13Q86W25 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NLRP13Q86W25 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NLRP13Q86W25 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NLRP13Q86W25 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.6 ms