Protein–RNA interactions for Protein: Q86TB9

PATL1, Protein PAT1 homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL1Q86TB9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PATL1Q86TB9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PATL1Q86TB9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PATL1Q86TB9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PATL1Q86TB9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PATL1Q86TB9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PATL1Q86TB9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PATL1Q86TB9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PATL1Q86TB9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PATL1Q86TB9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PATL1Q86TB9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PATL1Q86TB9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PATL1Q86TB9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PATL1Q86TB9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PATL1Q86TB9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PATL1Q86TB9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PATL1Q86TB9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PATL1Q86TB9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PATL1Q86TB9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PATL1Q86TB9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PATL1Q86TB9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PATL1Q86TB9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PATL1Q86TB9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PATL1Q86TB9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PATL1Q86TB9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PATL1Q86TB9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PATL1Q86TB9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PATL1Q86TB9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PATL1Q86TB9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PATL1Q86TB9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PATL1Q86TB9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PATL1Q86TB9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PATL1Q86TB9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PATL1Q86TB9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PATL1Q86TB9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PATL1Q86TB9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PATL1Q86TB9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PATL1Q86TB9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PATL1Q86TB9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PATL1Q86TB9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PATL1Q86TB9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PATL1Q86TB9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PATL1Q86TB9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PATL1Q86TB9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PATL1Q86TB9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PATL1Q86TB9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PATL1Q86TB9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PATL1Q86TB9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PATL1Q86TB9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PATL1Q86TB9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PATL1Q86TB9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PATL1Q86TB9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PATL1Q86TB9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PATL1Q86TB9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PATL1Q86TB9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PATL1Q86TB9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PATL1Q86TB9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PATL1Q86TB9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PATL1Q86TB9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PATL1Q86TB9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PATL1Q86TB9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PATL1Q86TB9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PATL1Q86TB9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PATL1Q86TB9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PATL1Q86TB9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PATL1Q86TB9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PATL1Q86TB9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PATL1Q86TB9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PATL1Q86TB9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PATL1Q86TB9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PATL1Q86TB9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PATL1Q86TB9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PATL1Q86TB9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PATL1Q86TB9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PATL1Q86TB9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PATL1Q86TB9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PATL1Q86TB9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PATL1Q86TB9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PATL1Q86TB9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PATL1Q86TB9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PATL1Q86TB9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PATL1Q86TB9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PATL1Q86TB9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PATL1Q86TB9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PATL1Q86TB9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PATL1Q86TB9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PATL1Q86TB9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PATL1Q86TB9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PATL1Q86TB9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PATL1Q86TB9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PATL1Q86TB9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PATL1Q86TB9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PATL1Q86TB9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PATL1Q86TB9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PATL1Q86TB9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PATL1Q86TB9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PATL1Q86TB9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PATL1Q86TB9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PATL1Q86TB9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PATL1Q86TB9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms