Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z408

CSMD2, CUB and sushi domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSMD2Q7Z408 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSMD2Q7Z408 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSMD2Q7Z408 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSMD2Q7Z408 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSMD2Q7Z408 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSMD2Q7Z408 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSMD2Q7Z408 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSMD2Q7Z408 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSMD2Q7Z408 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSMD2Q7Z408 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSMD2Q7Z408 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSMD2Q7Z408 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSMD2Q7Z408 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSMD2Q7Z408 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSMD2Q7Z408 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CSMD2Q7Z408 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSMD2Q7Z408 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSMD2Q7Z408 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSMD2Q7Z408 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSMD2Q7Z408 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSMD2Q7Z408 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSMD2Q7Z408 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSMD2Q7Z408 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSMD2Q7Z408 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSMD2Q7Z408 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSMD2Q7Z408 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSMD2Q7Z408 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSMD2Q7Z408 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSMD2Q7Z408 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSMD2Q7Z408 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CSMD2Q7Z408 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CSMD2Q7Z408 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSMD2Q7Z408 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSMD2Q7Z408 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSMD2Q7Z408 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSMD2Q7Z408 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSMD2Q7Z408 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSMD2Q7Z408 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSMD2Q7Z408 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSMD2Q7Z408 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSMD2Q7Z408 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSMD2Q7Z408 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSMD2Q7Z408 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CSMD2Q7Z408 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CSMD2Q7Z408 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CSMD2Q7Z408 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSMD2Q7Z408 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSMD2Q7Z408 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSMD2Q7Z408 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSMD2Q7Z408 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSMD2Q7Z408 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSMD2Q7Z408 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSMD2Q7Z408 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSMD2Q7Z408 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSMD2Q7Z408 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSMD2Q7Z408 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSMD2Q7Z408 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSMD2Q7Z408 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSMD2Q7Z408 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSMD2Q7Z408 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSMD2Q7Z408 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSMD2Q7Z408 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSMD2Q7Z408 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSMD2Q7Z408 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSMD2Q7Z408 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSMD2Q7Z408 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSMD2Q7Z408 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSMD2Q7Z408 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSMD2Q7Z408 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSMD2Q7Z408 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSMD2Q7Z408 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSMD2Q7Z408 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSMD2Q7Z408 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSMD2Q7Z408 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSMD2Q7Z408 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSMD2Q7Z408 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSMD2Q7Z408 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSMD2Q7Z408 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSMD2Q7Z408 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSMD2Q7Z408 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSMD2Q7Z408 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSMD2Q7Z408 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSMD2Q7Z408 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSMD2Q7Z408 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSMD2Q7Z408 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSMD2Q7Z408 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSMD2Q7Z408 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSMD2Q7Z408 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSMD2Q7Z408 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CSMD2Q7Z408 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSMD2Q7Z408 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CSMD2Q7Z408 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSMD2Q7Z408 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CSMD2Q7Z408 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSMD2Q7Z408 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSMD2Q7Z408 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSMD2Q7Z408 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSMD2Q7Z408 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSMD2Q7Z408 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSMD2Q7Z408 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms