Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF550Q7Z398 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF550Q7Z398 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF550Q7Z398 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF550Q7Z398 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF550Q7Z398 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF550Q7Z398 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF550Q7Z398 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF550Q7Z398 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF550Q7Z398 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF550Q7Z398 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF550Q7Z398 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF550Q7Z398 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF550Q7Z398 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF550Q7Z398 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF550Q7Z398 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF550Q7Z398 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF550Q7Z398 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF550Q7Z398 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF550Q7Z398 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF550Q7Z398 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF550Q7Z398 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF550Q7Z398 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF550Q7Z398 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF550Q7Z398 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF550Q7Z398 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF550Q7Z398 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF550Q7Z398 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF550Q7Z398 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF550Q7Z398 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF550Q7Z398 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF550Q7Z398 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF550Q7Z398 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF550Q7Z398 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF550Q7Z398 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF550Q7Z398 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF550Q7Z398 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF550Q7Z398 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF550Q7Z398 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF550Q7Z398 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF550Q7Z398 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF550Q7Z398 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF550Q7Z398 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF550Q7Z398 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF550Q7Z398 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF550Q7Z398 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF550Q7Z398 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF550Q7Z398 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF550Q7Z398 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF550Q7Z398 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF550Q7Z398 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF550Q7Z398 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF550Q7Z398 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF550Q7Z398 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF550Q7Z398 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF550Q7Z398 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF550Q7Z398 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF550Q7Z398 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF550Q7Z398 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF550Q7Z398 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF550Q7Z398 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF550Q7Z398 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF550Q7Z398 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF550Q7Z398 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF550Q7Z398 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF550Q7Z398 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF550Q7Z398 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF550Q7Z398 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF550Q7Z398 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF550Q7Z398 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF550Q7Z398 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF550Q7Z398 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF550Q7Z398 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF550Q7Z398 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF550Q7Z398 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF550Q7Z398 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF550Q7Z398 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF550Q7Z398 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF550Q7Z398 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF550Q7Z398 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF550Q7Z398 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF550Q7Z398 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF550Q7Z398 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF550Q7Z398 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF550Q7Z398 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF550Q7Z398 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF550Q7Z398 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF550Q7Z398 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF550Q7Z398 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF550Q7Z398 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF550Q7Z398 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF550Q7Z398 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF550Q7Z398 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF550Q7Z398 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF550Q7Z398 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF550Q7Z398 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF550Q7Z398 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF550Q7Z398 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF550Q7Z398 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF550Q7Z398 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms